More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1064 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  100 
 
 
447 aa  917  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  67.49 
 
 
444 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  63.29 
 
 
444 aa  598  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  62.84 
 
 
444 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  63.06 
 
 
444 aa  595  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  62.84 
 
 
444 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  62.84 
 
 
444 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  62.84 
 
 
444 aa  594  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  62.84 
 
 
444 aa  594  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  62.61 
 
 
444 aa  594  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  62.84 
 
 
444 aa  594  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  62.16 
 
 
444 aa  594  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.12112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  62.16 
 
 
444 aa  591  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  44.92 
 
 
435 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  44.1 
 
 
449 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  43.27 
 
 
453 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  41.65 
 
 
435 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  41.65 
 
 
435 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  42.57 
 
 
448 aa  360  4e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  42.51 
 
 
452 aa  355  6e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  41.91 
 
 
455 aa  355  8e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  40.32 
 
 
449 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  42.07 
 
 
452 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  41.91 
 
 
452 aa  339  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  44.14 
 
 
440 aa  338  1e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  40.31 
 
 
457 aa  328  2e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  40.31 
 
 
448 aa  326  4e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.93735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  43.05 
 
 
442 aa  319  6e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  42.22 
 
 
453 aa  316  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  39.33 
 
 
438 aa  312  9e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98868e-06 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  35.51 
 
 
462 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  39.86 
 
 
444 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  38 
 
 
448 aa  306  5e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  37.78 
 
 
448 aa  303  4e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  40 
 
 
446 aa  302  7e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  37.25 
 
 
442 aa  299  7e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  39.05 
 
 
448 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.25 
 
 
442 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  39.69 
 
 
424 aa  296  4e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  35.92 
 
 
451 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  36 
 
 
451 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  37.5 
 
 
452 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  37.95 
 
 
443 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  36.34 
 
 
451 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  37.5 
 
 
451 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  36.4 
 
 
440 aa  286  6e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  37.14 
 
 
453 aa  285  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.44 
 
 
449 aa  283  6e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  35.35 
 
 
443 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  36.83 
 
 
449 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  36.22 
 
 
452 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  36.47 
 
 
446 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  37.06 
 
 
449 aa  270  3e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  36.15 
 
 
456 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  34.29 
 
 
468 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  34.16 
 
 
428 aa  261  2e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  36.84 
 
 
430 aa  257  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  35.97 
 
 
453 aa  250  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  36.79 
 
 
464 aa  249  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  36.42 
 
 
451 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  34.93 
 
 
406 aa  243  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  33.7 
 
 
438 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  33.85 
 
 
438 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  37.41 
 
 
452 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  34.53 
 
 
451 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  32.31 
 
 
437 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  33.26 
 
 
438 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  34.38 
 
 
436 aa  232  8e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  35.25 
 
 
429 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  34.9 
 
 
435 aa  226  5e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  33.7 
 
 
444 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  33.58 
 
 
431 aa  226  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.85655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  34.9 
 
 
429 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  34.9 
 
 
429 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  35.27 
 
 
445 aa  226  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  34.18 
 
 
431 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  35.84 
 
 
429 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  35.84 
 
 
429 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  35.84 
 
 
429 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  35.84 
 
 
429 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  35.84 
 
 
429 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  35.84 
 
 
429 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  34.82 
 
 
429 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  35.84 
 
 
429 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  33.33 
 
 
501 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  36.06 
 
 
429 aa  223  5e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  35.62 
 
 
429 aa  223  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.51 
 
 
429 aa  223  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  33.7 
 
 
447 aa  222  1e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.8 
 
 
438 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  35.41 
 
 
431 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  37.05 
 
 
450 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl196  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.66 
 
 
425 aa  220  4e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0292309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  34.16 
 
 
431 aa  219  8e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  33.66 
 
 
430 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  34.6 
 
 
429 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  34.6 
 
 
429 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  34.6 
 
 
429 aa  217  3e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  34.38 
 
 
429 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  34.6 
 
 
429 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>