More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1040 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
155 aa  310  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  75.66 
 
 
154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  67.76 
 
 
152 aa  194  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  67.76 
 
 
152 aa  194  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  68.42 
 
 
152 aa  194  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  67.11 
 
 
152 aa  191  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3744  lipoprotein signal peptidase  67.76 
 
 
152 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00517012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3635  lipoprotein signal peptidase  67.76 
 
 
152 aa  184  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00213979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3652  lipoprotein signal peptidase  67.76 
 
 
152 aa  184  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1247  lipoprotein signal peptidase  67.76 
 
 
152 aa  184  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000373462  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4032  lipoprotein signal peptidase  67.76 
 
 
152 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000325041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3907  lipoprotein signal peptidase  67.76 
 
 
152 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000548028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3994  lipoprotein signal peptidase  67.11 
 
 
152 aa  183  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000820029  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  50.71 
 
 
161 aa  127  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  47.33 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  47.33 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 
202 aa  122  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 
235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 
165 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  45.65 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 
161 aa  111  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 
162 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  39.51 
 
 
164 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 
166 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 
154 aa  106  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 
168 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 
170 aa  104  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 
170 aa  103  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 
182 aa  103  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
170 aa  103  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 
170 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 
149 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 
176 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 
163 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 
164 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  37.16 
 
 
156 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
178 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
160 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  36.05 
 
 
164 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  36.05 
 
 
164 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 
164 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 
164 aa  97.1  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 
171 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 
171 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 
171 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 
171 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  32.89 
 
 
158 aa  94  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 
176 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  36.91 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  40.71 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 
171 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
170 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
170 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
170 aa  92  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 
171 aa  91.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
169 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
163 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
169 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
169 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
165 aa  91.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
171 aa  90.9  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.78 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 
170 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 
169 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  36.14 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
171 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>