More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0964 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 319 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  88.09 
 
 		 319 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.36 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.27 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.95 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.59 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  44.59 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  44.94 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  43.61 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.36 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.2 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.03 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.51 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.14 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.27 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.4 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.35 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.61 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.09 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.3 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.49 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.31 
 
 		 323 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.9 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.32 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.32 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.32 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.82 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.09 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.95 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.25 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.19 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.01 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  42.9 
 
 		 316 aa  235  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.93 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.68 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.63 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.63 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  41.82 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.41 
 
 		 334 aa  228  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.82 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.76 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.19 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  41.82 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.19 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.9 
 
 		 316 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.87 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.19 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  40.51 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  43.3 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  43.45 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.45 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.97 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.94 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.38 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.67 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.52 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.52 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.81 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  40 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.66 
 
 		 316 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.61 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.76 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.42 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  39.3 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.22 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.31 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  36.72 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.78 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  37.18 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  38.28 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  38.39 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  35.65 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.17 
 
 		 313 aa  179  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.22 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.52 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.53 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  31.58 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.13 
 
 		 369 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29975  predicted protein  37.62 
 
 		 346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  31.82 
 
 		 363 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.14 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.88 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03300  2-nitropropane dioxygenase, putative  37.22 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.42 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.6 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.6 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  34.65 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.94 
 
 		 378 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.76 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08801  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09600)  38.67 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.196554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  31.78 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.88 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.58 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.55 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  30.83 
 
 		 364 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  31.96 
 
 		 361 aa  155  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.62 
 
 		 353 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  30.75 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.86 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  30.56 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>