More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0934 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  367  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  40.35 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  39.77 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  39.63 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  39.51 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  38.55 
 
 
181 aa  111  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  42.13 
 
 
176 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.86 
 
 
169 aa  104  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  46.09 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  46.34 
 
 
159 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  45.53 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  45.24 
 
 
162 aa  92  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  43.55 
 
 
149 aa  91.3  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  44.35 
 
 
154 aa  90.5  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  42.95 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  43.37 
 
 
155 aa  87  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  42.62 
 
 
148 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  35.8 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  38.89 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  41.41 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  38.33 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  41.35 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  38.71 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  37.57 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  46.83 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  33.93 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  42.4 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.37 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  46.02 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  46.02 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  45.71 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  39.55 
 
 
262 aa  71.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  35.4 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  33.14 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  47.92 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  32.58 
 
 
283 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  36.21 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  32.26 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  30.11 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  42.59 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  35.71 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  36.54 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  48.36 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  33.12 
 
 
247 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  27.84 
 
 
258 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  36.52 
 
 
289 aa  63.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  37.39 
 
 
245 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  37.25 
 
 
273 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  44.62 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  30.43 
 
 
283 aa  62.4  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  32.62 
 
 
245 aa  62.4  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  34.21 
 
 
244 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  41.05 
 
 
260 aa  62.4  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  39.25 
 
 
245 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  29.73 
 
 
225 aa  62  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  32.59 
 
 
279 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  32.19 
 
 
318 aa  61.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  28.74 
 
 
264 aa  61.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  31.34 
 
 
269 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  38.46 
 
 
243 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  35.38 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  40.21 
 
 
261 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  28.33 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  27.53 
 
 
266 aa  60.1  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  40.48 
 
 
271 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  32.2 
 
 
332 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  32.46 
 
 
266 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  35.59 
 
 
216 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  30.15 
 
 
267 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  28.8 
 
 
251 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  28.3 
 
 
280 aa  58.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  39.73 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  32.37 
 
 
229 aa  58.2  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  35.34 
 
 
268 aa  58.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  30.71 
 
 
260 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  28.31 
 
 
242 aa  58.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  57.8  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  28.38 
 
 
319 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  36.52 
 
 
245 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  31.58 
 
 
284 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  33.93 
 
 
288 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  28.38 
 
 
319 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  29.92 
 
 
266 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2968  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.64 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  31.69 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  28.38 
 
 
319 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  25.28 
 
 
278 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  29.32 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  33.67 
 
 
313 aa  56.6  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  31.86 
 
 
243 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  29.32 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  36.26 
 
 
315 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  36.26 
 
 
292 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  36.26 
 
 
318 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  38.75 
 
 
287 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  28.05 
 
 
263 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  33.81 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>