58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0875 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3498  protein of unknown function UPF0236  71.37 
 
 
454 aa  660    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3360  protein of unknown function UPF0236  72.47 
 
 
455 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000531623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1931  protein of unknown function UPF0236  97.36 
 
 
455 aa  924    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1829  protein of unknown function UPF0236  96.07 
 
 
458 aa  913    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000497336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1615  protein of unknown function UPF0236  72.47 
 
 
455 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0133469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1481  protein of unknown function UPF0236  72.25 
 
 
455 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1419  protein of unknown function UPF0236  72.47 
 
 
455 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1252  protein of unknown function UPF0236  72.25 
 
 
455 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.578671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1055  protein of unknown function UPF0236  72.25 
 
 
455 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000029842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0875  protein of unknown function UPF0236  100 
 
 
455 aa  947    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0500  protein of unknown function UPF0236  72.47 
 
 
455 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0249  protein of unknown function UPF0236  72.25 
 
 
455 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2232  hypothetical protein  27.11 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00123188  unclonable  0.00000000989665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0921  hypothetical protein  27.79 
 
 
476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581224  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0511  protein of unknown function UPF0236  25 
 
 
467 aa  94.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.935045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08590  hypothetical protein  26.63 
 
 
434 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2764  protein of unknown function UPF0236  23.7 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000474396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1683  protein of unknown function UPF0236  23.7 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1256  protein of unknown function UPF0236  23.7 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00350537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0892  protein of unknown function UPF0236  23.7 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0729  protein of unknown function UPF0236  23.7 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0188  protein of unknown function UPF0236  23.7 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0092  protein of unknown function UPF0236  23.7 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0643  protein of unknown function UPF0236  23.97 
 
 
467 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0770  hypothetical protein  30 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1922  hypothetical protein  30 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1993  protein of unknown function UPF0236  24.05 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000779773  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1954  hypothetical protein  30 
 
 
471 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0069339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0046  protein of unknown function UPF0236  23.9 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00191865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0030  hypothetical protein  30 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00177404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0622  hypothetical protein  30 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0407627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0981  hypothetical protein  30 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1109  hypothetical protein  30 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00916427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1527  hypothetical protein  30 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2239  hypothetical protein  30 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.685977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1152  protein of unknown function UPF0236  25.2 
 
 
462 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2444  protein of unknown function UPF0236  25.2 
 
 
462 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2633  protein of unknown function UPF0236  25.2 
 
 
462 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0420  protein of unknown function UPF0236  23.9 
 
 
467 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000580166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0780  hypothetical protein  30 
 
 
472 aa  87.4  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0481  protein of unknown function UPF0236  24.17 
 
 
467 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1163  protein of unknown function UPF0236  24.68 
 
 
467 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00489953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0363  protein of unknown function UPF0236  24.63 
 
 
467 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00218859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08580  hypothetical protein  26.7 
 
 
459 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0817  hypothetical protein  30.64 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12010  hypothetical protein  25.59 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0722624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22880  hypothetical protein  25.59 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09850  hypothetical protein  25.59 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09340  hypothetical protein  25.59 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08430  hypothetical protein  25.59 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07130  hypothetical protein  25.59 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08860  hypothetical protein  25.59 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000384305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1837  protein of unknown function UPF0236  23.3 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0476  hypothetical protein  24.01 
 
 
460 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000243771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0745  hypothetical protein  24.01 
 
 
460 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1356  hypothetical protein  23.59 
 
 
402 aa  54.3  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2083  hypothetical protein  28.12 
 
 
187 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0573  hypothetical protein  33.1 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>