More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0827 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  78.11 
 
 
516 aa  792  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  78.11 
 
 
516 aa  790  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  93.15 
 
 
511 aa  920  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  77.91 
 
 
516 aa  793  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  78.11 
 
 
516 aa  792  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  77.91 
 
 
516 aa  790  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 
513 aa  1002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  78.3 
 
 
516 aa  795  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  78.3 
 
 
516 aa  794  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  64.2 
 
 
516 aa  641  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  78.11 
 
 
516 aa  793  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  78.11 
 
 
516 aa  792  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  76.92 
 
 
516 aa  786  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  78.11 
 
 
516 aa  792  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0143  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.83 
 
 
524 aa  525  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.74 
 
 
530 aa  523  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  48.69 
 
 
584 aa  519  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.69 
 
 
659 aa  517  1e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40042e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  48.16 
 
 
584 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  48.69 
 
 
584 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  47.49 
 
 
665 aa  501  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  47.31 
 
 
661 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  48.25 
 
 
664 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  55.24 
 
 
537 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.31 
 
 
515 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  47.9 
 
 
665 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.07835e-14 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  54.48 
 
 
536 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  47.29 
 
 
584 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  49.2 
 
 
515 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  49.6 
 
 
513 aa  471  1e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  50.84 
 
 
561 aa  468  1e-130  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.39 
 
 
557 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.39 
 
 
557 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.99279e-05 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  51.61 
 
 
551 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  48.27 
 
 
563 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  47.91 
 
 
519 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.52 
 
 
539 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  52.24 
 
 
568 aa  459  1e-128  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.05 
 
 
536 aa  460  1e-128  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  48.41 
 
 
541 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  48.21 
 
 
541 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  47.79 
 
 
554 aa  452  1e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.02 
 
 
541 aa  453  1e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  46.47 
 
 
577 aa  449  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  45.99 
 
 
552 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  45.98 
 
 
552 aa  448  1e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  48.24 
 
 
559 aa  448  1e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  45.68 
 
 
552 aa  446  1e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  45.29 
 
 
666 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  48.33 
 
 
548 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  45.38 
 
 
551 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  45.19 
 
 
551 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.41 
 
 
534 aa  440  1e-122  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  45.19 
 
 
551 aa  440  1e-122  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  44.73 
 
 
550 aa  440  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  46.68 
 
 
553 aa  441  1e-122  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  44.79 
 
 
552 aa  439  1e-122  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  45.44 
 
 
554 aa  441  1e-122  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  44.02 
 
 
552 aa  439  1e-122  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.06 
 
 
655 aa  439  1e-122  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  45.97 
 
 
554 aa  441  1e-122  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  45.97 
 
 
554 aa  440  1e-122  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  46.23 
 
 
520 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  44.89 
 
 
661 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.89 
 
 
561 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  45.89 
 
 
561 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  44.64 
 
 
551 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  46.23 
 
 
520 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.92 
 
 
560 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  45.78 
 
 
554 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  46.23 
 
 
520 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  46.43 
 
 
576 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  44.64 
 
 
551 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  3.16225e-14 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  46.62 
 
 
563 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  44.12 
 
 
552 aa  438  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  46.62 
 
 
563 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  46.8 
 
 
576 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  46.43 
 
 
576 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  44.81 
 
 
552 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  45.07 
 
 
549 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  45.07 
 
 
549 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.31 
 
 
508 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.31 
 
 
508 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  45.07 
 
 
549 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  44.71 
 
 
662 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  45.07 
 
 
549 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3288  Na+/solute symporter  45.01 
 
 
655 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  45.07 
 
 
549 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  45.49 
 
 
574 aa  435  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  46.23 
 
 
520 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.48 
 
 
570 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  46.75 
 
 
564 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  43.41 
 
 
659 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  46.48 
 
 
577 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  51.66 
 
 
528 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  46.64 
 
 
561 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.11 
 
 
575 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  49.49 
 
 
554 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  45.4 
 
 
549 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  49.61 
 
 
552 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>