228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0711 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
163 aa  318  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.20146e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  94.48 
 
 
163 aa  303  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  80.37 
 
 
163 aa  263  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  76.69 
 
 
163 aa  253  1e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  76.69 
 
 
163 aa  253  1e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  76.69 
 
 
163 aa  253  1e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  76.69 
 
 
163 aa  253  1e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  76.69 
 
 
163 aa  253  1e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  76.69 
 
 
163 aa  253  1e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  76.69 
 
 
163 aa  253  1e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  76.69 
 
 
163 aa  253  1e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  76.07 
 
 
163 aa  251  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  75.46 
 
 
163 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  61.35 
 
 
164 aa  202  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 
165 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  55.83 
 
 
163 aa  188  3e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  55.7 
 
 
161 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.15495e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 
161 aa  178  3e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.32382e-06  hitchhiker  2.62338e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  55.7 
 
 
161 aa  178  3e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.35771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
161 aa  176  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  55.49 
 
 
166 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  55.7 
 
 
161 aa  173  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  53.8 
 
 
161 aa  173  1e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  55.06 
 
 
161 aa  173  1e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  53.8 
 
 
161 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  52.5 
 
 
164 aa  165  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  49.37 
 
 
161 aa  157  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  50.62 
 
 
164 aa  153  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  45.57 
 
 
161 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  45.57 
 
 
161 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  47.17 
 
 
162 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  47.8 
 
 
162 aa  146  1e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  47.27 
 
 
165 aa  146  1e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.72661e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  43.67 
 
 
160 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  139  1e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  46.06 
 
 
165 aa  139  1e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  1.13677e-09 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  46.67 
 
 
165 aa  139  2e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  1.73634e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  44.24 
 
 
165 aa  136  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  45.45 
 
 
165 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  48.12 
 
 
162 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 
163 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  135  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  4.70515e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  135  3e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  44.3 
 
 
160 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
162 aa  134  6e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  46.91 
 
 
162 aa  133  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  44.85 
 
 
165 aa  132  1e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
163 aa  132  1e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1649  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
165 aa  132  2e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  47.85 
 
 
163 aa  132  2e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
163 aa  131  4e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  46.91 
 
 
163 aa  130  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  43.67 
 
 
161 aa  130  7e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  44.44 
 
 
164 aa  129  1e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  43.48 
 
 
164 aa  129  1e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 
162 aa  130  1e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  130  1e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  129  2e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  45.51 
 
 
167 aa  129  2e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  38.65 
 
 
163 aa  129  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  129  2e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  129  2e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  43.67 
 
 
160 aa  129  2e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  9.45037e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
179 aa  128  4e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
163 aa  128  4e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
179 aa  128  4e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
179 aa  128  4e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 
163 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  44.1 
 
 
161 aa  127  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
163 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
163 aa  127  9e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 
163 aa  126  1e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
161 aa  126  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  45.45 
 
 
165 aa  125  2e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  47.24 
 
 
163 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  45.34 
 
 
164 aa  124  4e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  38.04 
 
 
163 aa  124  4e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
163 aa  124  4e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
161 aa  124  8e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  40.99 
 
 
163 aa  124  8e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07510  hypothetical protein  45.45 
 
 
165 aa  123  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0112753  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  43.4 
 
 
159 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  46.3 
 
 
162 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  38.79 
 
 
165 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
161 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  38.79 
 
 
165 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1539  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
165 aa  122  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>