286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0672 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 393 aa  800    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  75.66 
 
 		 392 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  48.2 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  43.14 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  39.95 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  40.58 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  39.9 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  40.31 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  34.22 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  34.06 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  33.33 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  39.02 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  33.25 
 
 		 387 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  35.49 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.74 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.56 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  30.54 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  37.34 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.3 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  31.46 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  33.69 
 
 		 383 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  31.62 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  30 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  32.66 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.76 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  37.32 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  38.68 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  32.65 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  28.22 
 
 		 408 aa  163  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  29.76 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  35.64 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  35.64 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  35.64 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  34.67 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  31.64 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  28.07 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  35.4 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  39.42 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  31.64 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  32.19 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  34.34 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  31 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  37.98 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  33.49 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  32.62 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  36.73 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  30.2 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  29.7 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  29.84 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  34.58 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.55 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  29.84 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  29.7 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  29.7 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  29.7 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  38.75 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  34 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  30.46 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  30.46 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  30.46 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  30.46 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  30.46 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  30.46 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  36.4 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  33.23 
 
 		 411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  28.36 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  30.98 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  29.46 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.23 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  29.7 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  34.4 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  30.15 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  37.55 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  30.94 
 
 		 374 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  28.91 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  29.02 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  32.78 
 
 		 419 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  26.72 
 
 		 408 aa  145  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  32.83 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  31.79 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  30.51 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  40.38 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  26.51 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.23 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  34.8 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  29.69 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  29.18 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  31.44 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  36.01 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.51 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  32.19 
 
 		 407 aa  142  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.26 
 
 		 418 aa  142  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  29.69 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  36.74 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  28.22 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.29 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  35.66 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  28.87 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  35.66 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  29.38 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>