148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0668 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
206 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  81.73 
 
 
207 aa  348  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  53.57 
 
 
197 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  52.55 
 
 
197 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  51.02 
 
 
197 aa  226  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  51.02 
 
 
197 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  51.02 
 
 
197 aa  226  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  51.02 
 
 
197 aa  226  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  51.02 
 
 
197 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  51.02 
 
 
197 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  51.02 
 
 
197 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  50.51 
 
 
197 aa  225  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  50.51 
 
 
197 aa  225  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0551  hypothetical protein  29.5 
 
 
191 aa  122  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0963  hypothetical protein  28.5 
 
 
191 aa  121  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0982  hypothetical protein  28.5 
 
 
191 aa  121  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  28.31 
 
 
717 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  27.17 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2523  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.09 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.05 
 
 
713 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  26.26 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  26.26 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  28.05 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  31.25 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  27.81 
 
 
714 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  28.14 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  24.84 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.23 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  27.87 
 
 
240 aa  62  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.41 
 
 
235 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0728  hypothetical protein  28.74 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  25.32 
 
 
724 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  28.49 
 
 
182 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  25.5 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.78 
 
 
251 aa  59.3  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1727  SNARE associated Golgi protein  31.21 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  25.31 
 
 
803 aa  58.5  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  22.56 
 
 
714 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0639  hypothetical protein  27.97 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  30.26 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  30.17 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  24.84 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0516  SNARE associated Golgi protein  23.49 
 
 
182 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
267 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  28.05 
 
 
236 aa  55.5  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  23.74 
 
 
204 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  24.48 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  24.48 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  28.38 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0510  hypothetical protein  26.76 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00856705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0512  hypothetical protein  26.76 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000166734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  29.63 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  29.61 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0568  hypothetical protein  26.57 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0600  hypothetical protein  26.57 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0657  hypothetical protein  26.57 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85178e-22 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  21.31 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  21.31 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0515  SNARE associated Golgi protein  25.35 
 
 
182 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  24.73 
 
 
253 aa  52.4  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  28.97 
 
 
258 aa  52  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  24.81 
 
 
732 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  24.81 
 
 
732 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4699  hypothetical protein  26.57 
 
 
182 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000989349 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  24.82 
 
 
746 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  23.84 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  30.21 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  25.53 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  24.03 
 
 
732 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  25.53 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.53 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  30.51 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  28.16 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0956  SNARE associated Golgi protein  25.97 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  25.53 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  25.53 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  25.53 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  25.53 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  25.53 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  24.68 
 
 
238 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  23.08 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.65 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  28.81 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  26.99 
 
 
720 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1816  DedA family membrane protein  25.52 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.106663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  25.79 
 
 
325 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.49 
 
 
202 aa  48.5  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0758  SNARE associated Golgi protein  25.43 
 
 
250 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.826687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  24.82 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  23.81 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  28.41 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  28.41 
 
 
217 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  22.62 
 
 
701 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  25.84 
 
 
738 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  30.89 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  25.44 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  28.99 
 
 
728 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>