75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0636 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  100 
 
 
324 aa  661    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  80.85 
 
 
376 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  74.04 
 
 
314 aa  501  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  74.36 
 
 
314 aa  501  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  74.04 
 
 
314 aa  501  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  74.04 
 
 
314 aa  501  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  74.04 
 
 
314 aa  501  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  74.04 
 
 
314 aa  501  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  74.36 
 
 
314 aa  501  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  73.25 
 
 
318 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  74.04 
 
 
314 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  73.72 
 
 
314 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  73.4 
 
 
314 aa  494  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  55.33 
 
 
313 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  52.27 
 
 
313 aa  356  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  52.27 
 
 
313 aa  356  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  44.06 
 
 
325 aa  290  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  42.12 
 
 
316 aa  275  6e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  44.08 
 
 
322 aa  265  5e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  42.91 
 
 
313 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  41.29 
 
 
314 aa  253  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  41.2 
 
 
313 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  40.51 
 
 
323 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  40.51 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  37.42 
 
 
326 aa  205  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  36.33 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  38.03 
 
 
366 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 
384 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  40.15 
 
 
371 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  36.39 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  36.97 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  36.96 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  33.85 
 
 
328 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 
295 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 
347 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
343 aa  155  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 
377 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
315 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
361 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 
330 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 
343 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
327 aa  145  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
361 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 
336 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
347 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
528 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  33.44 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
531 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
534 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
534 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  30.08 
 
 
321 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  25.79 
 
 
333 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
354 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 
327 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  26.35 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  28.71 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
228 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 
228 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
249 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 
228 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
228 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  21.72 
 
 
309 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0662  putative hydrolase  29.01 
 
 
191 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0543  metal dependent phosphohydrolase  27.61 
 
 
221 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0659  hypothetical protein  36.62 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.418378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>