More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0593 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
283 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.52 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  46.98 
 
 
303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.15 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  42.55 
 
 
310 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.37 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.06 
 
 
299 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  32.26 
 
 
300 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  34.03 
 
 
311 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  36.03 
 
 
298 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  35.11 
 
 
291 aa  152  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  35.74 
 
 
297 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  35.29 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  36.21 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  33.57 
 
 
298 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  37.5 
 
 
295 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  35.25 
 
 
294 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  35.34 
 
 
302 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  37.17 
 
 
310 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  38.89 
 
 
322 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.83 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.43 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  33.81 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  36.43 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  36.4 
 
 
310 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  36.4 
 
 
310 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  36.4 
 
 
310 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  36.18 
 
 
308 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  36.18 
 
 
308 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  36.4 
 
 
302 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  37.04 
 
 
324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  36.4 
 
 
310 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  36.4 
 
 
310 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  36.4 
 
 
310 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  35.84 
 
 
308 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  36.03 
 
 
302 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  36.03 
 
 
310 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  39.23 
 
 
295 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  34.74 
 
 
308 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  34.74 
 
 
308 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  35.48 
 
 
301 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  35.58 
 
 
298 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  37.45 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  37.45 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  32.98 
 
 
308 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  37.64 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  39.78 
 
 
295 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  35.71 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  33.48 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  30.4 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  29.07 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  36.64 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  31.62 
 
 
296 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  31.42 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  31.93 
 
 
314 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 
290 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  33.83 
 
 
310 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 
307 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  33.46 
 
 
306 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  31.85 
 
 
304 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  32.33 
 
 
311 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.91 
 
 
301 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 
301 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.2 
 
 
320 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  31.03 
 
 
304 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  31.2 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  33.79 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  32.88 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.43 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.86 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  31.84 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.84 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  31.52 
 
 
320 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  29.12 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  25.72 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  31.87 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  31.82 
 
 
301 aa  87  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 
319 aa  85.9  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  29.12 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  32.51 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.75 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4726  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  42.57 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  28.46 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  27.69 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  28.57 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  28.02 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  29.26 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  28.89 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  29.6 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.89 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  29.6 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>