More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0494 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  100 
 
 
340 aa  701    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  44.21 
 
 
327 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  44.81 
 
 
327 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  43.62 
 
 
334 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  43.32 
 
 
334 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  43.32 
 
 
327 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  42.73 
 
 
334 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  41.32 
 
 
328 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  41.12 
 
 
340 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  41.12 
 
 
340 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  41.12 
 
 
340 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  41.12 
 
 
340 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  41.12 
 
 
340 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  41.12 
 
 
340 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  41.12 
 
 
340 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  41.12 
 
 
340 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  46.81 
 
 
279 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  40.83 
 
 
340 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  40.24 
 
 
340 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  46.95 
 
 
276 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.9 
 
 
340 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  42.51 
 
 
328 aa  255  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  50.23 
 
 
252 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  38.3 
 
 
368 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  34.39 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  43.16 
 
 
370 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  43.16 
 
 
360 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  43.59 
 
 
353 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  43.4 
 
 
353 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  34.39 
 
 
370 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  42.31 
 
 
360 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  44.02 
 
 
321 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
360 aa  208  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  43.59 
 
 
353 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  29.41 
 
 
337 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  30.37 
 
 
341 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  28.66 
 
 
337 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
350 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  30.5 
 
 
331 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
343 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  29.36 
 
 
342 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  38.97 
 
 
336 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  36.92 
 
 
336 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
331 aa  135  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  30.54 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  29 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  27.46 
 
 
346 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
334 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
341 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  28.28 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  30.28 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  25.38 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  26.39 
 
 
357 aa  106  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  28.44 
 
 
301 aa  106  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
452 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
452 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  30.38 
 
 
452 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  31.67 
 
 
452 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  29.92 
 
 
496 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  26.84 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
379 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
608 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
465 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 
350 aa  90.5  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
608 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  25.21 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  26.99 
 
 
469 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 
462 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 
680 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
410 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  25.91 
 
 
482 aa  86.3  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 
901 aa  86.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
405 aa  86.3  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 
621 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0793237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
600 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  25.88 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  25.08 
 
 
455 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
585 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  25.08 
 
 
455 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  30.93 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
609 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 
467 aa  84  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  22.19 
 
 
463 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  29 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
581 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
438 aa  82.8  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
535 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 
502 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>