79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0482 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0482  protein of unknown function DUF939  100 
 
 
353 aa  720    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  71.51 
 
 
359 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0529  putative lipoprotein  58.47 
 
 
362 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0584  putative lipoprotein  58.47 
 
 
381 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0512  putative lipoprotein  58.47 
 
 
362 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0497  putative lipoprotein  58.47 
 
 
362 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0436  hypothetical protein  58.47 
 
 
362 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0468809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0585  putative lipoprotein  58.47 
 
 
362 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0440  hypothetical protein  58.47 
 
 
362 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  58.79 
 
 
381 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0451  hypothetical protein  59.65 
 
 
394 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0533  putative lipoprotein  58.79 
 
 
362 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0945445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4792  putative lipoprotein  58.79 
 
 
362 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591787  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1402  hypothetical protein  36.29 
 
 
364 aa  215  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  35.39 
 
 
364 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  35.39 
 
 
364 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  34.09 
 
 
369 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  36.08 
 
 
368 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2854  protein of unknown function DUF939  25.09 
 
 
390 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2751  hypothetical protein  30.95 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182894 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  26.83 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2557  hypothetical protein  30.36 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000442188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2513  hypothetical protein  29.76 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2743  hypothetical protein  30.36 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2478  hypothetical protein  29.76 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000608339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2537  integral membrane protein  29.76 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000042014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2797  hypothetical protein  29.17 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  31.41 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  31.41 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2776  hypothetical protein  29.68 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1438  membrane protein-like protein  30.57 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  30.5 
 
 
359 aa  62.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  26.7 
 
 
395 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  29.56 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1808  hypothetical protein  27.95 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0309492  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1527  hypothetical protein  27.33 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210442  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  27.1 
 
 
338 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  24.54 
 
 
691 aa  53.1  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2288  protein of unknown function DUF939  27.33 
 
 
325 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.77 
 
 
653 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  31.54 
 
 
409 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  25.82 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2534  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2846  hypothetical protein  24.67 
 
 
322 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.701661  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  19.75 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  28.1 
 
 
708 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0303  protein of unknown function DUF939  27.16 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.77 
 
 
672 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.18 
 
 
651 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.18 
 
 
651 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.18 
 
 
651 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  25.83 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.46 
 
 
742 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0310  hypothetical protein  25.95 
 
 
165 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.68 
 
 
724 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2848  hypothetical protein  36.11 
 
 
193 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  27.1 
 
 
664 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  26.45 
 
 
664 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  22.54 
 
 
635 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  27.68 
 
 
724 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  23.67 
 
 
697 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  21.57 
 
 
676 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  19.1 
 
 
690 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3990  hypothetical protein  22.5 
 
 
322 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  21.84 
 
 
698 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.98 
 
 
670 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  20.29 
 
 
374 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4056  hypothetical protein  23.94 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0974  hypothetical protein  23.29 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00289539  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4373  hypothetical protein  23.94 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0189837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4171  hypothetical protein  23.94 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.781105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  19.81 
 
 
372 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4261  hypothetical protein  23.29 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0114239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  19.81 
 
 
372 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  24.53 
 
 
354 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3902  hypothetical protein  23.94 
 
 
322 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00608095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3895  hypothetical protein  22.81 
 
 
322 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000792929  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4282  hypothetical protein  23.94 
 
 
322 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000114221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4222  hypothetical protein  23.94 
 
 
322 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>