More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0443 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0443  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 673 aa  1373    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2022  penicillin-binding protein 3  44.95 
 
 		 661 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000411725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2084  penicillin-binding protein 3  44.95 
 
 		 661 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00596278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2022  penicillin-binding protein 3  44.95 
 
 		 661 aa  581  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00891602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2238  penicillin-binding protein 3  44.95 
 
 		 661 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000023716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2265  penicillin-binding protein 3  44.95 
 
 		 661 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4105599999999994e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2221  penicillin-binding protein 3  44.34 
 
 		 661 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00242094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2268  penicillin-binding protein  44.56 
 
 		 661 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000872752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2063  peptidoglycan glycosyltransferase  45.25 
 
 		 661 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00114706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2350  penicillin-binding protein 3  44.34 
 
 		 661 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000528095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3103  penicillin-binding protein 3  44.19 
 
 		 661 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0111919  hitchhiker  0.000000000000561272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1641  peptidoglycan glycosyltransferase  44.28 
 
 		 661 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000195033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2533  penicillin-binding protein  43.9 
 
 		 655 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0143777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2826  penicillin-binding protein 3  42.92 
 
 		 655 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110452 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2321  penicillin-binding protein transpeptidase  43.27 
 
 		 642 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2498  penicillin-binding protein 3  42.47 
 
 		 655 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2521  penicillin-binding protein 2'  36.29 
 
 		 668 aa  398  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00245242  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0029  peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 		 668 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0029  peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 		 668 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  30.25 
 
 		 775 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  28.04 
 
 		 802 aa  203  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  28.75 
 
 		 775 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  28.62 
 
 		 760 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  28.62 
 
 		 765 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  28.62 
 
 		 765 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.14 
 
 		 618 aa  200  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  28.04 
 
 		 809 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 		 761 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  28.04 
 
 		 803 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  27.92 
 
 		 756 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 		 764 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  28.47 
 
 		 646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  28.04 
 
 		 803 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  29.26 
 
 		 617 aa  198  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  29.26 
 
 		 617 aa  198  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  27.97 
 
 		 800 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  28.09 
 
 		 802 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  28.09 
 
 		 802 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  28.09 
 
 		 802 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  28.09 
 
 		 802 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  29.37 
 
 		 639 aa  197  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  27.9 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 		 673 aa  195  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  27.68 
 
 		 645 aa  195  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 		 618 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 618 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 618 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 		 618 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 618 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  28.52 
 
 		 612 aa  194  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  28.52 
 
 		 615 aa  193  8e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  29.36 
 
 		 646 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  30.04 
 
 		 646 aa  191  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 643 aa  191  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  29.33 
 
 		 646 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  27.97 
 
 		 771 aa  190  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 631 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  29.13 
 
 		 640 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  27.72 
 
 		 632 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  27.8 
 
 		 767 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  29.29 
 
 		 631 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  29.84 
 
 		 631 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  28.75 
 
 		 634 aa  187  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  28.05 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 636 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  28.9 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 		 634 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  28.73 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  28.73 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  27 
 
 		 626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  28.73 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 607 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  28.73 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  27.59 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  28.73 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  28.73 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  28.73 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 		 636 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  28.09 
 
 		 650 aa  184  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  27.77 
 
 		 801 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  28.98 
 
 		 634 aa  184  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  27.59 
 
 		 801 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  28.8 
 
 		 631 aa  184  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 		 633 aa  184  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  28.62 
 
 		 655 aa  183  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  27.76 
 
 		 609 aa  183  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  28.98 
 
 		 629 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  27.63 
 
 		 602 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  27.63 
 
 		 602 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  28.65 
 
 		 629 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  26.92 
 
 		 801 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  30.35 
 
 		 618 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  28 
 
 		 636 aa  182  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 		 618 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  28.65 
 
 		 629 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 		 618 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  28.25 
 
 		 596 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.39 
 
 		 642 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 		 610 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 		 618 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>