More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0382 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  75.68 
 
 		 551 aa  885    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 		 552 aa  1135    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  41.44 
 
 		 552 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  43.51 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  42.57 
 
 		 561 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  44.22 
 
 		 543 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  41.8 
 
 		 552 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  40.29 
 
 		 568 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  42.23 
 
 		 549 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  44.87 
 
 		 560 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  42.44 
 
 		 556 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  42.27 
 
 		 566 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  42.31 
 
 		 559 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  40.95 
 
 		 548 aa  432  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  42.16 
 
 		 575 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  41.58 
 
 		 559 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  42.4 
 
 		 575 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  41.38 
 
 		 582 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  40.44 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  41.53 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  41.3 
 
 		 555 aa  422  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  40.93 
 
 		 574 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 559 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  41.76 
 
 		 572 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  41.52 
 
 		 576 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  41.47 
 
 		 570 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  40.07 
 
 		 550 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  40.69 
 
 		 558 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  39.63 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  41.68 
 
 		 553 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 580 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  40.33 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  41.42 
 
 		 564 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  42 
 
 		 581 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  39.96 
 
 		 565 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  40.65 
 
 		 567 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  40.47 
 
 		 559 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.85 
 
 		 543 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  40.57 
 
 		 567 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  41.95 
 
 		 572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  40.91 
 
 		 567 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  40.91 
 
 		 567 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  40.93 
 
 		 572 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  39.23 
 
 		 564 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  40.64 
 
 		 567 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.79 
 
 		 572 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  40.79 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  40.76 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  40.76 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  40.91 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  40.76 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  40.55 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  40.61 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  40.76 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  40.76 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  40.76 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  40.76 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  40 
 
 		 567 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  38.32 
 
 		 559 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  38.92 
 
 		 567 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  39.61 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  39.39 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  39.78 
 
 		 558 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  41.21 
 
 		 558 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  38.53 
 
 		 561 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  37.32 
 
 		 538 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  36.86 
 
 		 561 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  38.63 
 
 		 568 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  36 
 
 		 567 aa  345  8.999999999999999e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.46 
 
 		 565 aa  336  7e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  35.22 
 
 		 551 aa  336  7e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  36.08 
 
 		 587 aa  334  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.11 
 
 		 554 aa  334  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.38 
 
 		 557 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.53 
 
 		 563 aa  325  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.14 
 
 		 556 aa  325  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  34.8 
 
 		 587 aa  324  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  34.93 
 
 		 587 aa  323  7e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.19 
 
 		 566 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.39 
 
 		 586 aa  317  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  34.97 
 
 		 587 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  35.53 
 
 		 583 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.58 
 
 		 552 aa  315  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  34 
 
 		 566 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.15 
 
 		 581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.9 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.59 
 
 		 557 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  34.78 
 
 		 577 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.78 
 
 		 581 aa  312  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.03 
 
 		 588 aa  310  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.89 
 
 		 558 aa  309  9e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.79 
 
 		 570 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.79 
 
 		 570 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.79 
 
 		 570 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.58 
 
 		 576 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.79 
 
 		 570 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  34.17 
 
 		 599 aa  307  3e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.26 
 
 		 560 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  32.78 
 
 		 560 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.2 
 
 		 535 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>