More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0356 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  100 
 
 
136 aa  271  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  68.75 
 
 
137 aa  190  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  57.81 
 
 
131 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  57.81 
 
 
131 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 
134 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  52.34 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
154 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
141 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  42.86 
 
 
139 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
136 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  38.1 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 
130 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.17 
 
 
360 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  42.52 
 
 
129 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  36.51 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  40 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  44.07 
 
 
363 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  40 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  39.37 
 
 
142 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.43 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.43 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.43 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  37.1 
 
 
139 aa  92  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  37.6 
 
 
318 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  44.07 
 
 
352 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.32 
 
 
314 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.76 
 
 
132 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
129 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.32 
 
 
314 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.32 
 
 
314 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  39.52 
 
 
314 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.34 
 
 
329 aa  87.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  42.37 
 
 
352 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.34 
 
 
329 aa  87.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.5 
 
 
140 aa  87  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.76 
 
 
132 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.98 
 
 
129 aa  87  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  37.98 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  37.98 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.98 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  37.98 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  37.21 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  37.9 
 
 
314 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.13 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  36.59 
 
 
317 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.13 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  37.1 
 
 
313 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  38.46 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  36.92 
 
 
135 aa  84  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  36.36 
 
 
314 aa  84  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  36 
 
 
133 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  37.9 
 
 
315 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 
147 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  39.39 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  39.39 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  39.47 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  39.47 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  36.22 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  38.28 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  36.75 
 
 
302 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 
386 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  35.66 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  33.33 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  35.48 
 
 
316 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  34.65 
 
 
399 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  37.1 
 
 
313 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  28.35 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  35.54 
 
 
383 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  37.1 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  35.16 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>