More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0231 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  63.88 
 
 
548 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  64.07 
 
 
548 aa  658    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  67.18 
 
 
544 aa  707    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  62.67 
 
 
546 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  61.47 
 
 
544 aa  676    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  75.14 
 
 
539 aa  802    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  64.57 
 
 
545 aa  675    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  64.94 
 
 
542 aa  691    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  63.88 
 
 
547 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  64.06 
 
 
545 aa  679    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  75.28 
 
 
540 aa  799    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  89.7 
 
 
544 aa  940    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  89.89 
 
 
544 aa  942    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  89.89 
 
 
544 aa  942    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  65.02 
 
 
550 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0426  chaperonin GroEL  63.38 
 
 
550 aa  656    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000639435  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  66.11 
 
 
541 aa  707    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  63.05 
 
 
547 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  63.89 
 
 
542 aa  672    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  64.52 
 
 
560 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  65.02 
 
 
546 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  64.38 
 
 
554 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  66.03 
 
 
551 aa  666    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  65.02 
 
 
546 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  67.24 
 
 
546 aa  700    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  65.54 
 
 
548 aa  690    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  89.7 
 
 
544 aa  940    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0631  chaperonin GroEL  61.94 
 
 
542 aa  657    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000011047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  62.01 
 
 
555 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
552 aa  672    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  62.22 
 
 
543 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  64.45 
 
 
548 aa  668    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  69.27 
 
 
539 aa  737    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  69.66 
 
 
536 aa  736    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1938  chaperonin GroEL  63.08 
 
 
546 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  65.02 
 
 
546 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
548 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  67.43 
 
 
547 aa  698    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  64.58 
 
 
541 aa  672    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  65.19 
 
 
540 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  62.99 
 
 
550 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  65.21 
 
 
547 aa  660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  62.36 
 
 
552 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0884  chaperonin, 60 kDa  62.31 
 
 
547 aa  657    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000145695  hitchhiker  0.0000472619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  63.45 
 
 
544 aa  673    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  63.81 
 
 
550 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  62.31 
 
 
540 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3815  chaperonin GroEL  64.07 
 
 
546 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000160857  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  62.31 
 
 
540 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1569  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
546 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0135  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
546 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129883  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  63.93 
 
 
550 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  62.67 
 
 
547 aa  667    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0591  chaperonin GroEL  63.57 
 
 
546 aa  654    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
553 aa  682    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  65.01 
 
 
545 aa  700    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  64.45 
 
 
547 aa  654    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  63.69 
 
 
539 aa  662    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  64.83 
 
 
546 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  61.08 
 
 
540 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  65.56 
 
 
541 aa  699    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  67.73 
 
 
540 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  61.87 
 
 
548 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  65.02 
 
 
544 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  63.77 
 
 
542 aa  675    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  63.5 
 
 
542 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  74.03 
 
 
539 aa  778    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  74.16 
 
 
539 aa  778    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0468  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
547 aa  655    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0739991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
561 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  69.39 
 
 
546 aa  734    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  63.38 
 
 
551 aa  664    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  64.83 
 
 
546 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  62.31 
 
 
540 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  71.98 
 
 
542 aa  753    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  69.26 
 
 
541 aa  751    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  70.63 
 
 
543 aa  764    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  72.68 
 
 
539 aa  778    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  75.51 
 
 
539 aa  790    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  65.59 
 
 
545 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  64.83 
 
 
546 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3522  chaperonin GroEL  64.19 
 
 
546 aa  663    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  61.08 
 
 
540 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  65.84 
 
 
543 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  64.86 
 
 
542 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
551 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  67.35 
 
 
539 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  64.58 
 
 
545 aa  678    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  64.31 
 
 
554 aa  676    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  66.73 
 
 
541 aa  706    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3124  chaperonin GroEL  64.5 
 
 
545 aa  658    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.549796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  65.56 
 
 
541 aa  699    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  65.43 
 
 
541 aa  692    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  65.84 
 
 
547 aa  690    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0912  chaperonin GroEL  65.02 
 
 
550 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31421  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  64.06 
 
 
545 aa  679    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0428  chaperonin GroEL  64.64 
 
 
548 aa  667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29083  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2742  chaperonin GroEL  65.02 
 
 
550 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  77.38 
 
 
541 aa  801    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3117  chaperonin GroEL  65.02 
 
 
546 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.222092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>