More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0230 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  100 
 
 
94 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  92.47 
 
 
94 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 
94 aa  154  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 
94 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 
94 aa  152  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
94 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
94 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
94 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
94 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
94 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
94 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
94 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 
94 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  70.65 
 
 
94 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  71.74 
 
 
96 aa  133  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  70.97 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  67.39 
 
 
95 aa  130  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  67.74 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  68.82 
 
 
95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  65.22 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  70.65 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  65.59 
 
 
94 aa  123  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  66.67 
 
 
98 aa  123  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  64.52 
 
 
94 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  64.52 
 
 
98 aa  122  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  63.04 
 
 
95 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
97 aa  120  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  65.59 
 
 
94 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  61.29 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  66.3 
 
 
94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 
95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1485  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
94 aa  118  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00014757  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  63.04 
 
 
98 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  62.37 
 
 
98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2067  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000661626  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2104  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00575627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 
98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  64.13 
 
 
102 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
103 aa  117  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2230  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
95 aa  116  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 
97 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  58.06 
 
 
97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
102 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
104 aa  114  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
95 aa  114  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1530  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
103 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
103 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
98 aa  114  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05031  hypothetical protein  61.96 
 
 
166 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  60.22 
 
 
106 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
95 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0391  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  65.59 
 
 
98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2170  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 
103 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100099 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
95 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
98 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
98 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
95 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
97 aa  113  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
98 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16271  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  60.64 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  58.89 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
103 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
96 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18371  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
103 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0969  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
103 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  56.99 
 
 
98 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0505  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
103 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.31516  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 
94 aa  111  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 
100 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
95 aa  111  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
96 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 
95 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>