More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0210 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  100 
 
 		 387 aa  810    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  76.12 
 
 		 384 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  56.92 
 
 		 389 aa  475  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  56.92 
 
 		 389 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  56.92 
 
 		 389 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  56.92 
 
 		 389 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  56.69 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  57.18 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  56.43 
 
 		 389 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  56.66 
 
 		 389 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  56.66 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  56.66 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  56.4 
 
 		 389 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  45.33 
 
 		 367 aa  322  7e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  46.34 
 
 		 366 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  43.11 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  42.6 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  42.09 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  42.86 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  42.09 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  42.89 
 
 		 392 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  46.03 
 
 		 375 aa  318  7.999999999999999e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  42.35 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  42.05 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  42.35 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  44.11 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  42.09 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  42.86 
 
 		 408 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  43.83 
 
 		 398 aa  301  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  44.47 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  44.47 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  40.31 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  41.82 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  39.16 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  40.8 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  42.01 
 
 		 373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  42.86 
 
 		 373 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  41.88 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  41.42 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  42.9 
 
 		 370 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  41.62 
 
 		 373 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  41.62 
 
 		 373 aa  279  6e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  38.34 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  39.9 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  41.21 
 
 		 380 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  41.16 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  41.67 
 
 		 371 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  41.18 
 
 		 377 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  40.68 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  39.95 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  37.4 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  39.84 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  38.08 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  42.54 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  39.23 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  38.72 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  38.72 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1941  alanine racemase  38.98 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0017462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  39.38 
 
 		 390 aa  256  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  35.88 
 
 		 390 aa  255  9e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  39.3 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  38.46 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  38.92 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  38.22 
 
 		 403 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  40.16 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  38.26 
 
 		 421 aa  249  8e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  43.72 
 
 		 849 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  43.44 
 
 		 844 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  37.27 
 
 		 434 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  37.96 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  37.37 
 
 		 851 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  38.46 
 
 		 406 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  37.5 
 
 		 379 aa  236  7e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  37.07 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  37.6 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  38.02 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  38.54 
 
 		 376 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0162  alanine racemase  35.75 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1641  alanine racemase  36.6 
 
 		 386 aa  232  9e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  38.79 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  37.3 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  37.08 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  36.56 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  38.03 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  39.25 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  39.51 
 
 		 811 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  34.83 
 
 		 374 aa  224  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  36.1 
 
 		 387 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  35.79 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  36.88 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  36.72 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  33.89 
 
 		 375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.59 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1888  alanine racemase  36.53 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  36.8 
 
 		 365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.03 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  34.82 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  35.34 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0422  alanine racemase  36 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  36.91 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>