More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0139 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
120 aa  241  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  97.5 
 
 
120 aa  237  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  89.17 
 
 
120 aa  221  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  72.66 
 
 
128 aa  185  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  71.09 
 
 
128 aa  183  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  74.59 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  74.59 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  68.5 
 
 
127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  72.13 
 
 
122 aa  170  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  69.05 
 
 
127 aa  169  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  68.25 
 
 
127 aa  167  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  67.77 
 
 
121 aa  167  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  68.33 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2374  50S ribosomal protein L17  69.84 
 
 
126 aa  159  9e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  60.77 
 
 
131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  61.16 
 
 
119 aa  148  2e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 
112 aa  147  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  60 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  60 
 
 
113 aa  145  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  60.5 
 
 
124 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
113 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
113 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  58.82 
 
 
127 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  59.83 
 
 
175 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 
178 aa  141  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  57.26 
 
 
168 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  54.17 
 
 
113 aa  136  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  56.9 
 
 
118 aa  135  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0669  50S ribosomal protein L17  55.37 
 
 
119 aa  136  1e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  57.5 
 
 
112 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 
155 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  57.5 
 
 
112 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  56.3 
 
 
116 aa  133  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 
184 aa  133  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  54.17 
 
 
112 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  55.56 
 
 
113 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  56.41 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  55.93 
 
 
117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  56.67 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 
141 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  50.83 
 
 
151 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  57.14 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 
140 aa  124  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 
140 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 
138 aa  123  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  54.62 
 
 
139 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 
138 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  51.72 
 
 
229 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 
141 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 
137 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  53.45 
 
 
179 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  55.08 
 
 
113 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
142 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  52.99 
 
 
126 aa  120  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  50.83 
 
 
114 aa  120  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  52.54 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 
140 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 
151 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 
139 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  50 
 
 
140 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 
140 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 
139 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 
139 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
161 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
152 aa  116  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  49.14 
 
 
268 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  51.67 
 
 
117 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 
135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 
147 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  48.28 
 
 
222 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 
117 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  50 
 
 
125 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 
172 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0312187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>