More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0126 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
178 aa  350  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  94.38 
 
 
178 aa  334  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 
179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 
179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 
179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 
179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 
179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 
179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  75.98 
 
 
179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 
179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 
179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  74.3 
 
 
179 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 
179 aa  270  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  69.66 
 
 
179 aa  253  9e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  66.85 
 
 
180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  68.82 
 
 
182 aa  251  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  69.59 
 
 
182 aa  250  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  68.54 
 
 
178 aa  239  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  68.82 
 
 
183 aa  239  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  67.98 
 
 
178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  67.98 
 
 
178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 
179 aa  234  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 
179 aa  234  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  62.71 
 
 
179 aa  230  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  62.36 
 
 
178 aa  230  9e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  65.88 
 
 
184 aa  229  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  64.25 
 
 
180 aa  228  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  64.2 
 
 
182 aa  228  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 
178 aa  225  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  61.24 
 
 
178 aa  224  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  64.04 
 
 
181 aa  222  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  64.33 
 
 
183 aa  222  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  59.36 
 
 
187 aa  220  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  60.67 
 
 
180 aa  218  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  61.8 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  59.32 
 
 
179 aa  218  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  62.92 
 
 
178 aa  217  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  61.58 
 
 
177 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  63.16 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  61.45 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  59.55 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 
187 aa  211  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  60.89 
 
 
180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 
178 aa  211  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  57.63 
 
 
177 aa  210  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  210  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 
176 aa  210  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  57.54 
 
 
179 aa  208  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  58.38 
 
 
187 aa  207  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  60.57 
 
 
177 aa  207  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 
177 aa  206  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 
178 aa  205  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 
179 aa  205  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  61.14 
 
 
177 aa  205  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 
179 aa  204  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  54.8 
 
 
181 aa  202  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
178 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  57.14 
 
 
177 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
180 aa  201  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  54.75 
 
 
179 aa  201  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  53.37 
 
 
178 aa  201  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  201  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  57.14 
 
 
177 aa  201  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  56.18 
 
 
178 aa  201  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  57.3 
 
 
179 aa  200  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  55.87 
 
 
179 aa  201  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
178 aa  199  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 
178 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  55.31 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  56.57 
 
 
177 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
178 aa  199  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  55.29 
 
 
182 aa  198  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  57.14 
 
 
177 aa  198  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  56 
 
 
177 aa  198  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 
177 aa  198  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  56.5 
 
 
177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  55.87 
 
 
179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  56.82 
 
 
178 aa  197  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  55.88 
 
 
182 aa  197  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  197  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  57.14 
 
 
177 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 
180 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  56.57 
 
 
177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 
177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  55.37 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
180 aa  195  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  56 
 
 
177 aa  195  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  53.85 
 
 
184 aa  195  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 
177 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
178 aa  194  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  55.37 
 
 
180 aa  194  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  54.95 
 
 
184 aa  194  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>