More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0116 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
113 aa  225  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  97.35 
 
 
113 aa  221  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 
113 aa  201  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 
113 aa  201  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 
113 aa  201  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 
113 aa  201  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 
113 aa  201  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 
113 aa  201  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 
113 aa  201  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  84.07 
 
 
113 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 
113 aa  201  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 
113 aa  201  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  82.3 
 
 
113 aa  200  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  77.68 
 
 
117 aa  180  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  76.79 
 
 
117 aa  178  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  76.79 
 
 
117 aa  178  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  72.57 
 
 
113 aa  170  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  73.87 
 
 
117 aa  169  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  70.54 
 
 
114 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  70.37 
 
 
118 aa  161  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  68.14 
 
 
113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  63.72 
 
 
113 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  68.75 
 
 
112 aa  154  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  62.39 
 
 
114 aa  148  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  67.89 
 
 
116 aa  148  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  62.39 
 
 
114 aa  148  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  65.14 
 
 
115 aa  148  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  62.83 
 
 
113 aa  147  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  62.83 
 
 
113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  60.91 
 
 
115 aa  143  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  63.96 
 
 
111 aa  141  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  57.66 
 
 
113 aa  141  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  60.71 
 
 
125 aa  141  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 
120 aa  140  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  61.82 
 
 
110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 
118 aa  138  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  60.75 
 
 
125 aa  137  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  60 
 
 
111 aa  137  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  60 
 
 
111 aa  137  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  59.17 
 
 
122 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  58.12 
 
 
125 aa  134  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  58.12 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  56.76 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  59.63 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  59.66 
 
 
121 aa  131  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  59.09 
 
 
122 aa  130  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  57.52 
 
 
113 aa  129  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  57.76 
 
 
122 aa  129  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  57.52 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  59.09 
 
 
125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  59.17 
 
 
122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  61.68 
 
 
158 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  59.46 
 
 
136 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  128  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  60.19 
 
 
212 aa  127  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  55.75 
 
 
120 aa  127  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 
159 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 
121 aa  126  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  59.63 
 
 
140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  56.88 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 
120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  54.17 
 
 
121 aa  124  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  53.57 
 
 
113 aa  124  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  53.45 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  55.75 
 
 
113 aa  123  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  62.75 
 
 
127 aa  123  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  58.82 
 
 
152 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  58.82 
 
 
152 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  53.33 
 
 
121 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  54.13 
 
 
113 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  56.76 
 
 
142 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  56.88 
 
 
133 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 
111 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 
111 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  56.36 
 
 
110 aa  120  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 
110 aa  120  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 
139 aa  120  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
111 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
117 aa  118  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 
146 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  53.64 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  117  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  116  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  51.4 
 
 
113 aa  116  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  53.64 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>