More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0114 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
276 aa  557  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  97.83 
 
 
276 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  87.32 
 
 
276 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  86.59 
 
 
276 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  86.59 
 
 
276 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  86.59 
 
 
276 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  86.59 
 
 
276 aa  498  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  85.87 
 
 
276 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  86.59 
 
 
276 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  86.59 
 
 
276 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  86.59 
 
 
276 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  85.51 
 
 
276 aa  498  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  85.87 
 
 
276 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  77.9 
 
 
277 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  77.9 
 
 
277 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  76.81 
 
 
277 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  76.45 
 
 
277 aa  443  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  76.09 
 
 
277 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  76.45 
 
 
276 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  73.99 
 
 
276 aa  425  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  72.46 
 
 
276 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  73.19 
 
 
275 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  74.91 
 
 
275 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 
276 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  73.45 
 
 
275 aa  410  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  72.99 
 
 
275 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  71.74 
 
 
275 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  70.29 
 
 
276 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 
281 aa  403  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  69.6 
 
 
280 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  68.84 
 
 
276 aa  396  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  70.29 
 
 
275 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  69.93 
 
 
274 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  68.84 
 
 
276 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  69.34 
 
 
277 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  69.34 
 
 
277 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  69.45 
 
 
278 aa  395  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  68.36 
 
 
275 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  70.55 
 
 
273 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 
277 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  67.75 
 
 
276 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  67.03 
 
 
277 aa  385  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  66.79 
 
 
281 aa  382  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 
275 aa  381  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  67.38 
 
 
281 aa  382  1e-105  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  68.23 
 
 
279 aa  380  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  68 
 
 
277 aa  382  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  67.75 
 
 
277 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  64.29 
 
 
281 aa  379  1e-104  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 
279 aa  374  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
275 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  65.33 
 
 
283 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  63.77 
 
 
278 aa  370  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  68.98 
 
 
281 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
275 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
287 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
287 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  67.69 
 
 
274 aa  359  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 
274 aa  358  5e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  64.23 
 
 
276 aa  358  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
274 aa  358  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  64.13 
 
 
274 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 
276 aa  355  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 
276 aa  355  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 
277 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 
287 aa  352  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 
274 aa  352  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  62.73 
 
 
279 aa  352  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  62.73 
 
 
287 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  63.1 
 
 
287 aa  350  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 
274 aa  349  3e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  60.74 
 
 
287 aa  348  6e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  61.68 
 
 
274 aa  348  6e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
274 aa  348  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
274 aa  348  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  65.33 
 
 
276 aa  348  7e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  61.96 
 
 
275 aa  347  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  65.82 
 
 
273 aa  346  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
287 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 
287 aa  345  4e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 
274 aa  345  6e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3992  ribosomal protein L2  61.96 
 
 
275 aa  344  7e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  63.9 
 
 
276 aa  345  7e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  63.9 
 
 
276 aa  345  7e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  57.93 
 
 
287 aa  344  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  62.32 
 
 
275 aa  344  8e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0229  50S ribosomal protein L2  61.29 
 
 
279 aa  343  2e-93  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.116801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
274 aa  342  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
274 aa  341  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  60.89 
 
 
287 aa  340  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
279 aa  339  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  59.41 
 
 
287 aa  338  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 
274 aa  338  5e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  59.41 
 
 
287 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  57.56 
 
 
287 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0770  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 
276 aa  337  9.999999999999999e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00209717  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 
275 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>