74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0085 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  100 
 
 		 364 aa  724    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  87.09 
 
 		 364 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  71.12 
 
 		 367 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  70.73 
 
 		 369 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  70.73 
 
 		 369 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  70.73 
 
 		 369 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  70.73 
 
 		 369 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  70.73 
 
 		 369 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  71.08 
 
 		 370 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  71 
 
 		 369 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  70.84 
 
 		 367 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  59.95 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  77.43 
 
 		 257 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  57.14 
 
 		 383 aa  359  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  57.63 
 
 		 380 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  56.49 
 
 		 367 aa  342  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  51.88 
 
 		 388 aa  338  7e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  52.75 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  52.32 
 
 		 383 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  48.78 
 
 		 368 aa  328  9e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  48.51 
 
 		 368 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  46.8 
 
 		 380 aa  324  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  59.35 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  56.8 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  47.84 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  53.99 
 
 		 369 aa  294  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  85.12 
 
 		 168 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  53.48 
 
 		 384 aa  278  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  39.04 
 
 		 357 aa  269  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  39.04 
 
 		 357 aa  269  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  45.56 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  47.96 
 
 		 346 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  44.75 
 
 		 357 aa  264  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  41.21 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  41.85 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  45.27 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  41.23 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  41.23 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  40.62 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  38.48 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  45.25 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  62.37 
 
 		 269 aa  249  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  44.9 
 
 		 358 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  39.45 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  39.24 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  48.18 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  40.8 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  42.72 
 
 		 364 aa  228  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  36.76 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  37.64 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  35.22 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  35.98 
 
 		 385 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  34.95 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  49.25 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  46.27 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  38.04 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  41.06 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  41.06 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  41.06 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  35.67 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0094  hypothetical protein  56.77 
 
 		 161 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  37.55 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  40.65 
 
 		 369 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  34.04 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  33.87 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  38.89 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 344 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  49.74 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0114  hypothetical protein  56.98 
 
 		 87 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.448893  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  32.48 
 
 		 630 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  31.9 
 
 		 630 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  31.9 
 
 		 630 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  32.48 
 
 		 634 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  27.81 
 
 		 633 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>