More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0075 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 73 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  82.86 
 
 		 73 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  74.24 
 
 		 67 aa  104  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 67 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  72.73 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  71.21 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  71.21 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  71.21 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  71.21 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  71.21 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  71.21 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  71.21 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0070  XRE family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 52 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  51.56 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 252 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 256 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 436 aa  50.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  43.94 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  44.07 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 488 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  41.94 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  37.7 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 196 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  42.62 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 505 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 387 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 219 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  38.71 
 
 		 302 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  36.36 
 
 		 308 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  34.85 
 
 		 303 aa  45.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  39.66 
 
 		 421 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1743  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 402 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  39.66 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  36.67 
 
 		 477 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  39.66 
 
 		 421 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 361 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>