203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0054 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 90 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  86.75 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  80.23 
 
 		 91 aa  136  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  77.91 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  77.91 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  77.91 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  77.91 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  77.91 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  77.91 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  77.91 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  77.91 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  77.91 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  77.91 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  70.37 
 
 		 93 aa  115  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  62.35 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  56.67 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  67.9 
 
 		 90 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  62.65 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  73.68 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  73.68 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  57.65 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  64.29 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  59.04 
 
 		 100 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  64.56 
 
 		 91 aa  103  9e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.76 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  54.43 
 
 		 80 aa  90.5  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  50.6 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  50.63 
 
 		 80 aa  88.6  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  50.59 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.43 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.79 
 
 		 81 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  55 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  48.19 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  52.63 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  51.69 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  46.99 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  48.15 
 
 		 81 aa  76.6  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  48.75 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  47.22 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  42.86 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.19 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  47.22 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  47.22 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.84 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  43.94 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  42.5 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  37.88 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  42.31 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.03 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  42.42 
 
 		 81 aa  57  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  42.42 
 
 		 81 aa  57  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  40.91 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  47.06 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.18 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  50 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  41.27 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  39.74 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  47.06 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  41.77 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.74 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  37.65 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  41.03 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.29 
 
 		 77 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  39.74 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.74 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  43.04 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.29 
 
 		 77 aa  52.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3976  heat shock protein 15  35.9 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  37.5 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  38.46 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  38.33 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0176  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.9 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3737  heat shock protein 15  35.9 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1368  RNA-binding S4 domain protein  35.37 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  38.46 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  34.18 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.9 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  34.44 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  41.67 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.9 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  34.62 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  38.46 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4903  RNA-binding S4 domain protein  35.37 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  38.46 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0313  RNA-binding S4 domain protein  38.46 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0313  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  38.46 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3678  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  38.46 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  38.46 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4705  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  38.46 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.39239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  34.52 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  44.9 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.9 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  44.23 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  34.62 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68630  putative heat shock protein  38.46 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>