More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0027 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 
337 aa  696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  72.24 
 
 
330 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  52.91 
 
 
327 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  52.29 
 
 
327 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  52.6 
 
 
327 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  51.68 
 
 
327 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  52.29 
 
 
327 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  52.29 
 
 
327 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  51.99 
 
 
327 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  52.29 
 
 
327 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  52.29 
 
 
327 aa  363  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  52.29 
 
 
327 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  53.82 
 
 
327 aa  358  8e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  40.57 
 
 
326 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  34.57 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.06 
 
 
320 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.59 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  36.53 
 
 
321 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  34.66 
 
 
286 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.64 
 
 
326 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  32.79 
 
 
308 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  32.79 
 
 
308 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.39 
 
 
320 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.39 
 
 
320 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.25 
 
 
323 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.18 
 
 
335 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.23 
 
 
318 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.43 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.97 
 
 
327 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.06 
 
 
330 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1574  DNA polymerase III subunit delta'  45 
 
 
287 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  40 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  29.55 
 
 
308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.38 
 
 
340 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.57 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  38.18 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  31.34 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.67 
 
 
478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.67 
 
 
478 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.39 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.36 
 
 
501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.11 
 
 
427 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.56 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.04 
 
 
588 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.15 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.3 
 
 
554 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  43.45 
 
 
284 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.18 
 
 
586 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 
499 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.69 
 
 
363 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.69 
 
 
589 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  37.8 
 
 
669 aa  124  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  28.35 
 
 
320 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.24 
 
 
602 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.18 
 
 
320 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  39.77 
 
 
568 aa  122  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.69 
 
 
540 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.41 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  28.44 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.51 
 
 
551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.06 
 
 
614 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.37 
 
 
688 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.55 
 
 
518 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.92 
 
 
550 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.77 
 
 
567 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.4 
 
 
565 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.4 
 
 
565 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.12 
 
 
460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.26 
 
 
562 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.31 
 
 
559 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.77 
 
 
547 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  33.18 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  39.39 
 
 
324 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.78 
 
 
737 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.82 
 
 
550 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  27.14 
 
 
631 aa  117  3e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.4 
 
 
561 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.01 
 
 
455 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.76 
 
 
579 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.9 
 
 
354 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.76 
 
 
582 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  34.65 
 
 
304 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.49 
 
 
447 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  42.21 
 
 
548 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.18 
 
 
612 aa  115  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  39.74 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.36 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
611 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.53 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.31 
 
 
599 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.13 
 
 
527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  39.87 
 
 
579 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.5 
 
 
322 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.87 
 
 
560 aa  114  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  32.19 
 
 
529 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.31 
 
 
644 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.14 
 
 
724 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.36 
 
 
570 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.49 
 
 
589 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.43 
 
 
554 aa  114  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>