More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3404 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  486  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  78.33 
 
 		 248 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  78.33 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  69.58 
 
 		 246 aa  344  6e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  67.92 
 
 		 247 aa  342  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  67.49 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  68.72 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  69.55 
 
 		 248 aa  338  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.5 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.92 
 
 		 284 aa  332  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  67.08 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  65.42 
 
 		 246 aa  330  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  66.25 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  67.08 
 
 		 240 aa  328  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  68.31 
 
 		 243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  66.25 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  68.75 
 
 		 244 aa  325  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  66.38 
 
 		 249 aa  325  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  65.83 
 
 		 255 aa  325  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  65 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  66.39 
 
 		 243 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  67.5 
 
 		 239 aa  322  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  63.33 
 
 		 241 aa  320  9.000000000000001e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  66.67 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  63.75 
 
 		 242 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  63.75 
 
 		 242 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  65.57 
 
 		 246 aa  318  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  64.73 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  65.83 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  65.83 
 
 		 257 aa  316  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  65.83 
 
 		 240 aa  315  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  63.33 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  62.08 
 
 		 243 aa  315  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 240 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  61.92 
 
 		 247 aa  312  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  63.11 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  65 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  62.5 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  63.52 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  64.44 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  62.08 
 
 		 242 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 		 244 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  62.34 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.92 
 
 		 244 aa  309  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  62.08 
 
 		 240 aa  308  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  63.33 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.9 
 
 		 243 aa  307  8e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  64.44 
 
 		 246 aa  307  9e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  61.67 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  60.83 
 
 		 244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  63.75 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  63.83 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  61.67 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.92 
 
 		 244 aa  305  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 269 aa  305  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  61.92 
 
 		 249 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.83 
 
 		 244 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  61.51 
 
 		 262 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 		 251 aa  305  6e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  61.51 
 
 		 262 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  60.25 
 
 		 269 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  61.67 
 
 		 246 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  61.09 
 
 		 267 aa  304  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  61.51 
 
 		 249 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  60.25 
 
 		 258 aa  304  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  61.51 
 
 		 268 aa  304  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  60.25 
 
 		 258 aa  304  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  61.09 
 
 		 262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  60.67 
 
 		 257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  63.33 
 
 		 240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  61.09 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  60.25 
 
 		 257 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  59.58 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  62.34 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.92 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  62.08 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  61.92 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  63.83 
 
 		 246 aa  301  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  61.92 
 
 		 249 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  59.58 
 
 		 242 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  60.83 
 
 		 258 aa  301  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 		 251 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  61.92 
 
 		 258 aa  301  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  60.83 
 
 		 246 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  61.67 
 
 		 251 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  60.42 
 
 		 245 aa  301  8.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  60.57 
 
 		 263 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5022  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 		 244 aa  300  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.33 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  59.58 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  61.09 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>