287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3390 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.45 
 
 		 302 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.89 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  50.92 
 
 		 308 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  52.48 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.42 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  42.4 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  42.4 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  42.4 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  42.05 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  42.05 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  41.05 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.82 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  42.2 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  39.64 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  39.64 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  39.35 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.07 
 
 		 295 aa  199  7e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  42.05 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  40.89 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.92 
 
 		 293 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  41.11 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  39.79 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  34.32 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  34 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  34 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  34.33 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  34.47 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  34.13 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  34.13 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  33 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  34.13 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  33.67 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.05 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.21 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.81 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.46 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  34.69 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  36.86 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.31 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  38.81 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.33 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  38.13 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  33.78 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  44.07 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  30.61 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  31.31 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.85 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.89 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.36 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  35.93 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.61 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.94 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.62 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.34 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  32.39 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  36.96 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  29.82 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  29.14 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  35.43 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  38.38 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  28.47 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  34.87 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.34 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  29.12 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  29.12 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  35.09 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  34.17 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  28 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  30.18 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.86 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.62 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  30.5 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  26.72 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  31.48 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  26.74 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.69 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.98 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  23.63 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  22.03 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  27.72 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  23.38 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  29.96 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  24.4 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  22.27 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  26.94 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.67 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.11 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  24.4 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.58 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>