More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3373 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3373  Sun protein  100 
 
 
448 aa  899    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  66.52 
 
 
446 aa  608  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  61.43 
 
 
448 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  57.17 
 
 
448 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  56.95 
 
 
448 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  56.88 
 
 
452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  49.89 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  43.24 
 
 
457 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  42.49 
 
 
453 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  44.91 
 
 
451 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  42.95 
 
 
452 aa  339  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  37.56 
 
 
455 aa  338  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  43.15 
 
 
449 aa  335  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  40.63 
 
 
452 aa  329  7e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  43.89 
 
 
451 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  38.69 
 
 
449 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.69 
 
 
449 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  37.95 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  37.14 
 
 
452 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  40.62 
 
 
468 aa  316  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  37.92 
 
 
443 aa  315  8e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  39.37 
 
 
446 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  42.89 
 
 
444 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  39.78 
 
 
443 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  39.05 
 
 
451 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  39.01 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  35.59 
 
 
444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  39.5 
 
 
444 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  38.34 
 
 
453 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  37.1 
 
 
440 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  39.05 
 
 
447 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  38.83 
 
 
444 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  38.83 
 
 
444 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  38.83 
 
 
444 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  38.6 
 
 
444 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  38.6 
 
 
444 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  38.6 
 
 
444 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  38.6 
 
 
444 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  38.6 
 
 
444 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  37.25 
 
 
444 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  38.6 
 
 
444 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  39.51 
 
 
451 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.39 
 
 
442 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  35.02 
 
 
456 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  33.71 
 
 
442 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  32.68 
 
 
462 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  33.41 
 
 
435 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  40.54 
 
 
439 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  35.54 
 
 
430 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  39.91 
 
 
453 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  32.05 
 
 
435 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  32.05 
 
 
435 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  38.72 
 
 
451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  36.78 
 
 
432 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.15 
 
 
445 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  37.08 
 
 
445 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  36.54 
 
 
452 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  36.22 
 
 
449 aa  249  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  38.33 
 
 
429 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  38.08 
 
 
429 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  38.08 
 
 
429 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  38.67 
 
 
429 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  38.42 
 
 
429 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  38.42 
 
 
429 aa  246  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  38.42 
 
 
429 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  38.42 
 
 
429 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  38.42 
 
 
429 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  38.67 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  37.84 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  38.42 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  37.59 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  38.75 
 
 
445 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  33.33 
 
 
437 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  32.35 
 
 
438 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  37.59 
 
 
429 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  38.43 
 
 
450 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  35.47 
 
 
471 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.93 
 
 
438 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  32.35 
 
 
438 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  38.18 
 
 
429 aa  242  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  38.07 
 
 
436 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.98 
 
 
427 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  36.75 
 
 
431 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  37.31 
 
 
431 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  36.74 
 
 
427 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  33.09 
 
 
438 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  34.38 
 
 
448 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  36.03 
 
 
431 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  38.92 
 
 
429 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  37.96 
 
 
447 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  32.69 
 
 
406 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  39.9 
 
 
448 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  37.2 
 
 
429 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  38.24 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0053  sun protein  42.86 
 
 
437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  38.24 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.8 
 
 
438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  37.5 
 
 
434 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  36.06 
 
 
435 aa  234  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  40.24 
 
 
436 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>