244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3348 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3348  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
301 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0041  Hsp33-like chaperonin  75.08 
 
 
301 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3554  Hsp33-like chaperonin  67.13 
 
 
295 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3620  Hsp33-like chaperonin  65.38 
 
 
295 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0022  Hsp33 protein  65.69 
 
 
240 aa  322  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3228  Hsp33 protein  54.55 
 
 
291 aa  322  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0369  Hsp33 protein  54.33 
 
 
284 aa  315  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0218109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0277  redox-related putative chaperone  51.4 
 
 
288 aa  296  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3383  Hsp33 protein  52.41 
 
 
304 aa  292  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.133262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0066  Hsp33-like chaperonin  46.53 
 
 
295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000194487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0064  Hsp33-like chaperonin  48.08 
 
 
296 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0062  Hsp33-like chaperonin  43.64 
 
 
291 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1868  Hsp33-like chaperonin  46.37 
 
 
316 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2157  Hsp33-like chaperonin  46.37 
 
 
319 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1343  Hsp33 protein  43.9 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000573361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0062  Hsp33-like chaperonin  43.99 
 
 
291 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1374  Hsp33 protein  45.83 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000113565  hitchhiker  0.0000000423891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10630  Hsp33 protein  44.18 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000018588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0074  Hsp33-like chaperonin  44.33 
 
 
291 aa  249  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.638833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0065  Hsp33-like chaperonin  44.33 
 
 
291 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0066  Hsp33-like chaperonin  44.33 
 
 
291 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0062  Hsp33-like chaperonin  44.33 
 
 
291 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0062  Hsp33-like chaperonin  44.33 
 
 
291 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0078  Hsp33-like chaperonin  44.33 
 
 
291 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0075  Hsp33-like chaperonin  44.33 
 
 
291 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.05774 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0066  Hsp33-like chaperonin  44.33 
 
 
291 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.77319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0950  Hsp33 protein  47.37 
 
 
301 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000811074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5242  Hsp33-like chaperonin  44.33 
 
 
291 aa  248  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0777269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1852  Hsp33 protein  43.71 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000569764  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0151  Hsp33-like chaperonin  40.83 
 
 
293 aa  240  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0534  Hsp33-like chaperonin  41.18 
 
 
293 aa  240  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0547  Hsp33-like chaperonin  41.18 
 
 
293 aa  240  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3417  Hsp33 protein  41.52 
 
 
292 aa  232  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2900  Hsp33 protein  39.86 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000174602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1050  Hsp33 protein  43.79 
 
 
295 aa  231  8.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0269  Hsp33-like chaperonin  41.16 
 
 
306 aa  229  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146823  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24260  disulfide bond chaperone  43.71 
 
 
308 aa  227  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2063  Hsp33-like chaperonin  41.26 
 
 
294 aa  219  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0278  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
306 aa  218  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.175456  normal  0.0234968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0204  Hsp33 protein  42.11 
 
 
297 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1272  Hsp33-like chaperonin  41.75 
 
 
300 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2283  Hsp33-like chaperonin  38.64 
 
 
311 aa  205  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0230  Hsp33-like chaperonin  37.54 
 
 
288 aa  202  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0405  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  36.81 
 
 
297 aa  200  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5185  Hsp33-like chaperonin  40.07 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000472348 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2209  Hsp33-like chaperonin  37.76 
 
 
288 aa  197  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3840  Hsp33 protein  40.29 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000889682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2817  Hsp33 protein  41.84 
 
 
308 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1824  Hsp33-like chaperonin  35.17 
 
 
291 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0258  Hsp33 protein  36.36 
 
 
297 aa  189  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000999551  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2869  Hsp33-like chaperonin  39.32 
 
 
301 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3227  Hsp33-like chaperonin  39.32 
 
 
301 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0755  Hsp33 protein  34.95 
 
 
284 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1023  Hsp33 protein  38.83 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0559  Hsp33-like chaperonin  40.54 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.136601  normal  0.555659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2399  Hsp33 protein  39.46 
 
 
344 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0189  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  33.22 
 
 
299 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.8305  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15846  predicted protein  40.67 
 
 
291 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.718386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4200  Hsp33-like chaperonin  39.18 
 
 
301 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1389  Hsp33 protein  39.69 
 
 
290 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1435  Hsp33 protein  39.69 
 
 
290 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0097  Hsp33-like chaperonin  37.21 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.708069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07221  Hsp33-like chaperonin  37.21 
 
 
299 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409809 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0302  Hsp33 protein  36.67 
 
 
287 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1282  Hsp33-like chaperonin  37.79 
 
 
305 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07201  Hsp33-like chaperonin  35.43 
 
 
302 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07381  Hsp33-like chaperonin  34.67 
 
 
300 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07751  Hsp33-like chaperonin  33.89 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056735 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0553  Hsp33 protein  39.52 
 
 
303 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07181  Hsp33-like chaperonin  33.33 
 
 
302 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0665  Hsp33-like chaperonin  33.44 
 
 
300 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.294105  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1195  Hsp33-like chaperonin  36.91 
 
 
305 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.688399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0157  Hsp33 protein  32.34 
 
 
311 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1493  Hsp33 protein  32.64 
 
 
289 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.364161  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33525  predicted protein  27.85 
 
 
364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0450  Hsp33 protein  34.15 
 
 
295 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0449  Hsp33 protein  34.15 
 
 
295 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  32.77 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0421  Hsp33 protein  33.8 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.93816  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2554  heat shock protein 34  27.41 
 
 
292 aa  106  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  27.18 
 
 
286 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  25.27 
 
 
281 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4148  Hsp33 protein  33.45 
 
 
294 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.21226  hitchhiker  0.00565171 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  25.27 
 
 
281 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl018  putative hsp33 redox-regulated chaperone  26.46 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3275  Hsp33 protein  30.32 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1220  Hsp33-like chaperonin  30.66 
 
 
344 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188087  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  26.3 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2285  Hsp33-like chaperonin  29.07 
 
 
335 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  31.05 
 
 
284 aa  95.9  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2009  Hsp33-like chaperonin  28.03 
 
 
335 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729287  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0830  Hsp33-like chaperonin  29.58 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  29.97 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2316  Hsp33-like chaperonin  28.72 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  29.43 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1971  Hsp33-like chaperonin  27.68 
 
 
335 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0467896 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0020  chaperonin HSP33  21.84 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  27.84 
 
 
286 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  28.14 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  26.96 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>