More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3312 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3312  ferrochelatase  100 
 
 
317 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00205193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0019  ferrochelatase  87.26 
 
 
317 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0173  ferrochelatase  74.6 
 
 
319 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0038  ferrochelatase  68.05 
 
 
317 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0641223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0039  ferrochelatase  68.05 
 
 
317 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2715  ferrochelatase  67.52 
 
 
322 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2930  ferrochelatase  67.74 
 
 
316 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0770  ferrochelatase  48.26 
 
 
352 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154008  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1503  ferrochelatase  46.33 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0845  ferrochelatase  45.48 
 
 
335 aa  282  6.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  44.62 
 
 
387 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  44.2 
 
 
387 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  44.2 
 
 
387 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  43.99 
 
 
388 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  45.17 
 
 
391 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45357  predicted protein  45.18 
 
 
509 aa  264  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0976017  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  43.99 
 
 
387 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4517  ferrochelatase  45.11 
 
 
387 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000264771  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  45.48 
 
 
391 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  44.69 
 
 
391 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  44.62 
 
 
387 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2831  predicted protein  43.25 
 
 
366 aa  259  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00315896  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  43.96 
 
 
391 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  44.69 
 
 
387 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  43.61 
 
 
391 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  43.34 
 
 
391 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  43.48 
 
 
391 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  43.93 
 
 
391 aa  252  7e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  42.72 
 
 
391 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05281  ferrochelatase  41.43 
 
 
391 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01700  ferrochelatase, putative  41.43 
 
 
413 aa  238  9e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1130  ferrochelatase  42.49 
 
 
319 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104879  hitchhiker  0.00676039 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3617  ferrochelatase  41.12 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1186  ferrochelatase  41.27 
 
 
315 aa  231  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2474  ferrochelatase  38.32 
 
 
362 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0132426  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1198  ferrochelatase  42.02 
 
 
443 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1258  ferrochelatase  40.74 
 
 
348 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1670  ferrochelatase  38.61 
 
 
312 aa  212  7e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07752  mitochondrial ferrochelatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07750)  38.62 
 
 
419 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.412365 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0790  ferrochelatase  39.74 
 
 
325 aa  207  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1090  ferrochelatase  42.27 
 
 
320 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0623  ferrochelatase  35.62 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.235291  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36859  ferrochelatase precursor  36.91 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2972  ferrochelatase  36.51 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5017  ferrochelatase  38.63 
 
 
348 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400702  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0918  ferrochelatase  34.38 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1218  Ferrochelatase  41.9 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1149  Ferrochelatase  41.59 
 
 
320 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2206  ferrochelatase  32.91 
 
 
330 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0613952  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0053  ferrochelatase  38.31 
 
 
317 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0988  ferrochelatase  36.99 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0395  ferrochelatase  33.75 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2090  ferrochelatase  34.38 
 
 
306 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  35.38 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0610  ferrochelatase  36.07 
 
 
303 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.926829  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0531  ferrochelatase  36.07 
 
 
309 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.95446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0703  ferrochelatase  32.7 
 
 
314 aa  169  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  34.58 
 
 
344 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1433  ferrochelatase  36.07 
 
 
303 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  34.43 
 
 
348 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3547  ferrochelatase  32.29 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1069  ferrochelatase  34.18 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  31.78 
 
 
362 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  33.64 
 
 
350 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  33.33 
 
 
342 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  33.02 
 
 
344 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0772  ferrochelatase  36.42 
 
 
317 aa  159  5e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.291247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  32.92 
 
 
350 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  32.41 
 
 
356 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  32.41 
 
 
356 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  33.23 
 
 
352 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  33.23 
 
 
352 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  30.46 
 
 
354 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  33.64 
 
 
367 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  33.64 
 
 
367 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  33.64 
 
 
367 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  33.64 
 
 
367 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  32.71 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  32.4 
 
 
360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  31.89 
 
 
356 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  33.64 
 
 
367 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  33.64 
 
 
367 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  33.54 
 
 
353 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  32.09 
 
 
360 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  33.95 
 
 
327 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  34.56 
 
 
365 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  33.95 
 
 
327 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  33.95 
 
 
327 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  35.29 
 
 
398 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  31.85 
 
 
344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  33.33 
 
 
367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  33.75 
 
 
345 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  32.3 
 
 
360 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  34.29 
 
 
336 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  33.64 
 
 
370 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  30.53 
 
 
370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  33.64 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  32 
 
 
354 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  31.99 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  33.13 
 
 
345 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>