51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3311 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  72.15 
 
 		 299 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  72.54 
 
 		 299 aa  417  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  71.96 
 
 		 299 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  71.19 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  67.56 
 
 		 299 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  60.74 
 
 		 302 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  39.59 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  31.65 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  36.55 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  34.21 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  34.62 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  36.84 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  35.95 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  28.47 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  30.22 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  33.08 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  31.29 
 
 		 185 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  26.54 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  26.09 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  26.09 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  26.09 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.52 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  25.76 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  25.76 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  25.76 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5252  hypothetical protein  29.17 
 
 		 185 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  26.28 
 
 		 196 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2403  hypothetical protein  28.1 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00420  GGDEF domain protein  25.46 
 
 		 464 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2647  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 		 498 aa  52.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.835336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0484  hypothetical protein  23.78 
 
 		 166 aa  52.8  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.875691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0506  hypothetical protein  28 
 
 		 152 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 578 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3244  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 454 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.79 
 
 		 432 aa  49.7  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000498313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1836  hypothetical protein  31.93 
 
 		 151 aa  49.7  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.43 
 
 		 485 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.911865  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0762  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.06 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0230415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.92 
 
 		 450 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00328784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 		 481 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0844  hypothetical protein  27.83 
 
 		 172 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0384719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.06 
 
 		 432 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457708  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1194  diguanylate cyclase  27.78 
 
 		 471 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361877  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1314  hypothetical protein  32.47 
 
 		 80 aa  46.2  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3654  diguanylate cyclase  23.46 
 
 		 473 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271139  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1847  diguanylate cyclase  26.17 
 
 		 470 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.85 
 
 		 415 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>