More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3308 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 433 aa  882    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  79.72 
 
 		 430 aa  719    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  86.25 
 
 		 430 aa  767    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  76.05 
 
 		 432 aa  701    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  75.81 
 
 		 432 aa  703    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  83.26 
 
 		 431 aa  754    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  78.32 
 
 		 430 aa  714    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  67.37 
 
 		 431 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  59.07 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  59.21 
 
 		 432 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  59.21 
 
 		 432 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  59.21 
 
 		 432 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  55.24 
 
 		 429 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  56.64 
 
 		 427 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  56.18 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  55.58 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.48 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  56.88 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  52.68 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  54.67 
 
 		 432 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  54.08 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  56.44 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  55.66 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  56.18 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  52.63 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  53.63 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  54.19 
 
 		 444 aa  478  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  53.63 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  53.49 
 
 		 447 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  53.63 
 
 		 430 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 430 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  53.49 
 
 		 447 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  54.31 
 
 		 432 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.74 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  51.95 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 430 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  53.83 
 
 		 442 aa  474  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  55.14 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 		 429 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 		 429 aa  471  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  53.79 
 
 		 438 aa  471  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  53.72 
 
 		 447 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  54.44 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 		 429 aa  471  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 		 429 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  53.85 
 
 		 431 aa  471  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  55.13 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  53.02 
 
 		 426 aa  471  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  54.85 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  54.61 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  54.02 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  49.42 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  54.02 
 
 		 438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 428 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  53.88 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  53.02 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  52.82 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5102  adenylosuccinate synthetase  53.44 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 431 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  52.4 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  52.63 
 
 		 446 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  53.02 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  52.38 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  52.19 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  57.01 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1226  adenylosuccinate synthetase  52.4 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000419397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 		 431 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 		 437 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2245  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  53.24 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 		 437 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  53.29 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>