218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3294 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  84.16 
 
 
404 aa  729  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  8.71777e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  100 
 
 
404 aa  836  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  68.32 
 
 
404 aa  604  1e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.96505e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  48.12 
 
 
404 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.83 
 
 
397 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.03 
 
 
396 aa  358  1e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  43.03 
 
 
402 aa  355  6e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  44.67 
 
 
403 aa  353  4e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  41.37 
 
 
387 aa  349  6e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 
404 aa  346  4e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  46.11 
 
 
400 aa  346  4e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  42.28 
 
 
387 aa  342  8e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 
387 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  41.6 
 
 
399 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  7.05459e-05 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  40.99 
 
 
407 aa  340  3e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  43.64 
 
 
391 aa  337  2e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.16658e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  41.56 
 
 
402 aa  335  8e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  44.88 
 
 
387 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  40.35 
 
 
418 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  40.61 
 
 
395 aa  328  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.7389e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 
405 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  39.04 
 
 
392 aa  326  6e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 
401 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  39.54 
 
 
387 aa  320  2e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1153  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 
405 aa  320  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  39.65 
 
 
392 aa  314  2e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  44.35 
 
 
394 aa  312  6e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.65 
 
 
400 aa  311  1e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  39.4 
 
 
402 aa  310  3e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.25952e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.93 
 
 
397 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.19 
 
 
505 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.85 
 
 
479 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.35155e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.85 
 
 
479 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.85 
 
 
479 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  38.4 
 
 
402 aa  296  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.85 
 
 
479 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.35 
 
 
498 aa  295  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.6 
 
 
479 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.1 
 
 
494 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.6 
 
 
479 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  38.6 
 
 
479 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.6 
 
 
479 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.6 
 
 
479 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.6 
 
 
479 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 
396 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.34 
 
 
493 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.44 
 
 
504 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 
479 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.35 
 
 
479 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.6 
 
 
479 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  38.54 
 
 
405 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.35 
 
 
479 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.8 
 
 
485 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  39.55 
 
 
396 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.11538e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.1 
 
 
499 aa  290  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.1 
 
 
503 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  38.52 
 
 
397 aa  289  5e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.36277e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.68 
 
 
401 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.34 
 
 
482 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.18 
 
 
500 aa  285  1e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
407 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.63 
 
 
406 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
407 aa  260  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.57 
 
 
397 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.88 
 
 
407 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1554  beta-lactamase-like  36.21 
 
 
410 aa  243  4e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0457538  normal  0.358726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
407 aa  234  2e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  35.77 
 
 
399 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  35.77 
 
 
399 aa  233  4e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 
396 aa  233  6e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 
400 aa  232  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  35.61 
 
 
393 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 
398 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 
397 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.25791e-05  hitchhiker  6.1463e-07 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0955  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 
409 aa  227  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.86403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  30.75 
 
 
396 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  34.06 
 
 
884 aa  223  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  32.11 
 
 
878 aa  221  2e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  32.11 
 
 
878 aa  221  2e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 
407 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 
399 aa  216  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  31.96 
 
 
407 aa  214  2e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 
407 aa  213  4e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  33.25 
 
 
508 aa  213  5e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  31.51 
 
 
431 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  31.2 
 
 
407 aa  209  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  30.88 
 
 
423 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
425 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  32.96 
 
 
401 aa  206  6e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
407 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
396 aa  201  2e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.65819e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 
395 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.74578e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 
421 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  33.89 
 
 
395 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  35 
 
 
378 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
402 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 
393 aa  186  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.98 
 
 
394 aa  185  1e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  3.51493e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  28.86 
 
 
409 aa  184  2e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  31.5 
 
 
411 aa  183  4e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>