More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3279 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 613 aa  1241    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  56.3 
 
 		 604 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  57.5 
 
 		 623 aa  725    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  54.35 
 
 		 612 aa  648    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  64.36 
 
 		 636 aa  830    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  72.28 
 
 		 614 aa  920    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  57.66 
 
 		 649 aa  723    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  60.69 
 
 		 617 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  45.8 
 
 		 716 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  46.02 
 
 		 707 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  45.87 
 
 		 707 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  45.87 
 
 		 707 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  41.32 
 
 		 624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  43.77 
 
 		 677 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  42.18 
 
 		 689 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40.59 
 
 		 607 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.46 
 
 		 607 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  40.46 
 
 		 607 aa  443  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 588 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  41.92 
 
 		 613 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  41.27 
 
 		 641 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  40.96 
 
 		 653 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.79 
 
 		 625 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 620 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 620 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  40.65 
 
 		 613 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  42.05 
 
 		 609 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  40.86 
 
 		 626 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  41.88 
 
 		 614 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.74 
 
 		 685 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  40.2 
 
 		 611 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.59 
 
 		 613 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.54 
 
 		 598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 615 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  38.95 
 
 		 669 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  40.49 
 
 		 617 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  38.88 
 
 		 665 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  40.49 
 
 		 617 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  40.75 
 
 		 607 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  39.38 
 
 		 604 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 		 613 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  38.83 
 
 		 626 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 604 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 		 607 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  39.41 
 
 		 607 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  40.46 
 
 		 619 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 		 607 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 608 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  38.49 
 
 		 708 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  38.31 
 
 		 599 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 		 616 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  38.92 
 
 		 636 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  39.12 
 
 		 585 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37.73 
 
 		 671 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 		 645 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.75 
 
 		 611 aa  392  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.79 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  38.64 
 
 		 608 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  36.77 
 
 		 625 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  38.04 
 
 		 656 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  42.57 
 
 		 615 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 658 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  36.77 
 
 		 627 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.19 
 
 		 619 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 		 599 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 		 610 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  40.72 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 		 617 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  37.91 
 
 		 649 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 		 607 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  38.06 
 
 		 607 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  38.47 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 		 613 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.85 
 
 		 628 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.85 
 
 		 628 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  38.22 
 
 		 607 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  38.14 
 
 		 614 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 608 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  38.46 
 
 		 684 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 		 609 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  37.03 
 
 		 638 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  38.16 
 
 		 624 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 591 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 		 609 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  37.46 
 
 		 649 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  36.16 
 
 		 591 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 		 641 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  38.57 
 
 		 693 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  38.82 
 
 		 690 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  35.4 
 
 		 593 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  38.05 
 
 		 670 aa  375  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 		 644 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  35.74 
 
 		 644 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  37.56 
 
 		 646 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 622 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  39.04 
 
 		 607 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 		 590 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>