34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3273 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3273  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  713    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0026213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2833  hypothetical protein  74.77 
 
 		 224 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.14005e-16  hitchhiker  0.0000000000194487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2222  hypothetical protein  57.89 
 
 		 226 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000231366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3032  hypothetical protein  55.78 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.574114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0788  hypothetical protein  53.69 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1219  hypothetical protein  56.28 
 
 		 247 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3682  hypothetical protein  50.51 
 
 		 259 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000140139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1791  hypothetical protein  47.06 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00579846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0068  hypothetical protein  48.04 
 
 		 239 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0691082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0880  hypothetical protein  47.37 
 
 		 299 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2832  hypothetical protein  83.7 
 
 		 100 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000013823  hitchhiker  0.0000000000634669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1220  hypothetical protein  68.82 
 
 		 96 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3031  hypothetical protein  70.33 
 
 		 96 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.467621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1790  hypothetical protein  57.61 
 
 		 112 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0789  hypothetical protein  58.24 
 
 		 104 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000285782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1815  hypothetical protein  54.55 
 
 		 92 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0283  hypothetical protein  49.44 
 
 		 93 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0498899  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2677  hypothetical protein  50.54 
 
 		 93 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0624  hypothetical protein  28.65 
 
 		 207 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000644203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0610  hypothetical protein  28.65 
 
 		 207 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967706  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1586  hypothetical protein  47.73 
 
 		 91 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000433454  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1455  hypothetical protein  31.74 
 
 		 183 aa  85.9  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0578  hypothetical protein  30.5 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.108637  normal  0.54693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0357  hypothetical protein  25.25 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4684  hypothetical protein  28.81 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000601642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0164  hypothetical protein  27.89 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1566  hypothetical protein  29.71 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2336  hypothetical protein  26.95 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0307  hypothetical protein  29.73 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0315  hypothetical protein  40.85 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0965  hypothetical protein  27.78 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00137731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4685  hypothetical protein  33.7 
 
 		 154 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000340895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1196  hypothetical protein  30.77 
 
 		 95 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2288  hypothetical protein  25.22 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000373742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>