133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3264 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  808    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
432 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 
444 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  37.44 
 
 
449 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  33.65 
 
 
416 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  31.9 
 
 
458 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
421 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
426 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  35.05 
 
 
437 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
428 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  31.4 
 
 
425 aa  143  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  28.13 
 
 
447 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  27.88 
 
 
408 aa  123  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 
421 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
451 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  26.1 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
433 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  26.65 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  25.84 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1697  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
375 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
424 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  26.12 
 
 
460 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
439 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  26.39 
 
 
430 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  25.06 
 
 
427 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 
427 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 
427 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  25.06 
 
 
427 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  25.06 
 
 
427 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  27.72 
 
 
436 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  26.18 
 
 
427 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  24.31 
 
 
427 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  25.37 
 
 
427 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  26.64 
 
 
462 aa  100  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  25.52 
 
 
436 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  28.12 
 
 
443 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  24.94 
 
 
427 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  25.3 
 
 
429 aa  96.3  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  25.72 
 
 
469 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  25.13 
 
 
427 aa  96.3  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  24.59 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
450 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  24.18 
 
 
463 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  26.46 
 
 
440 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
465 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  27.27 
 
 
449 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
445 aa  89.7  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  24.46 
 
 
462 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  23.84 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  28 
 
 
460 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
467 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  27.11 
 
 
465 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  25.13 
 
 
467 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  25.13 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  22.22 
 
 
474 aa  84.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  26.11 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
458 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  24.83 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  26.99 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  22.91 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  25.18 
 
 
460 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  28.32 
 
 
454 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  27.95 
 
 
453 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  26.57 
 
 
493 aa  77  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 
572 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  25.5 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  23.93 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
469 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
442 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  26.92 
 
 
453 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  25.83 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  22.94 
 
 
466 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  23.34 
 
 
454 aa  70.1  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  22.31 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  22.53 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  24.07 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  21.85 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
469 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  27.94 
 
 
464 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
456 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  24.74 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  24.74 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  24.74 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  24.08 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  27.8 
 
 
464 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
468 aa  64.3  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  22.33 
 
 
439 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 
454 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  24.09 
 
 
445 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
472 aa  63.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  25.99 
 
 
462 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>