More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3260 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  100 
 
 		 357 aa  741    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  85.71 
 
 		 357 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  78.15 
 
 		 357 aa  597  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  75.84 
 
 		 356 aa  564  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  75.84 
 
 		 356 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  73.14 
 
 		 355 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  65.17 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  53.93 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  48.17 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  44.94 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  44.94 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  41.41 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  37.95 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  36.77 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  36.21 
 
 		 375 aa  229  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  37.17 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.36 
 
 		 382 aa  222  7e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  35.65 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  33.89 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  34.53 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.25 
 
 		 382 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34.54 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.61 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  34.99 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  33.15 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  34.08 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  34.26 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  32.31 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  32.31 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  32.59 
 
 		 362 aa  195  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.28 
 
 		 382 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  31.11 
 
 		 385 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.28 
 
 		 382 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  32.37 
 
 		 363 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.59 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.72 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  30.36 
 
 		 384 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.03 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.56 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  32.69 
 
 		 384 aa  189  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  32.04 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  32.46 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.77 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  32.41 
 
 		 384 aa  186  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.92 
 
 		 387 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  30.19 
 
 		 386 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  31.7 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  31.94 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  30 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  31.29 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  29.25 
 
 		 384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  29.25 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.85 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  32.97 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  30.3 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  31.68 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.69 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  29.38 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  31.75 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  30.19 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  31.56 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  33.06 
 
 		 417 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  32.51 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  31.96 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  32.05 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  32.32 
 
 		 397 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  30.08 
 
 		 382 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  31.79 
 
 		 402 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  31.42 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  32.07 
 
 		 402 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  31.52 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  31.22 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.39 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  31.25 
 
 		 402 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  28.73 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.42 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  32.36 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  32.42 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  32.42 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  32.94 
 
 		 389 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  30.23 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  28.53 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  29.01 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  30.08 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  31.4 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  30.62 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  29.97 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  32.24 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  30.41 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  30.45 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  29.89 
 
 		 395 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  32.46 
 
 		 367 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  33.61 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  30.77 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  28.69 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  31.22 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  30.11 
 
 		 382 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  31.29 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  29.27 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>