More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3254 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  73.65 
 
 
836 aa  1322    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  100 
 
 
836 aa  1720    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  43.86 
 
 
828 aa  707    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  56.21 
 
 
842 aa  1001    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  89.22 
 
 
836 aa  1565    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  73.53 
 
 
836 aa  1303    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  71.38 
 
 
835 aa  1276    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  77.96 
 
 
835 aa  1372    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  72.57 
 
 
835 aa  1288    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  39.18 
 
 
830 aa  631  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  38.64 
 
 
843 aa  628  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  37.95 
 
 
827 aa  628  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  39.95 
 
 
840 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  39.23 
 
 
842 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  39.83 
 
 
835 aa  616  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  39.83 
 
 
841 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  39 
 
 
842 aa  618  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.69 
 
 
842 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  38.44 
 
 
832 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  39.2 
 
 
832 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  38.07 
 
 
827 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  38.75 
 
 
832 aa  599  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  37.77 
 
 
833 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.67 
 
 
828 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  37.72 
 
 
834 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  37.41 
 
 
843 aa  569  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  36.78 
 
 
828 aa  567  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  35.89 
 
 
841 aa  560  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  36.13 
 
 
818 aa  551  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.4 
 
 
837 aa  549  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  35.73 
 
 
816 aa  546  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  33.65 
 
 
810 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  35.53 
 
 
830 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  35.89 
 
 
828 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  35.45 
 
 
820 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  32.81 
 
 
820 aa  515  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  35.24 
 
 
833 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  33.81 
 
 
818 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  33.45 
 
 
821 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  31.69 
 
 
776 aa  429  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  28.05 
 
 
854 aa  426  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.55 
 
 
784 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  28.32 
 
 
784 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.43 
 
 
784 aa  396  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.76 
 
 
784 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.43 
 
 
784 aa  396  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.76 
 
 
784 aa  396  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29 
 
 
785 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  28.64 
 
 
784 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.5 
 
 
784 aa  389  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.35 
 
 
784 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  28.43 
 
 
784 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  31.59 
 
 
712 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.83 
 
 
343 aa  271  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  36.74 
 
 
370 aa  267  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  36.19 
 
 
370 aa  267  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  37.28 
 
 
392 aa  263  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  37.27 
 
 
399 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  35.08 
 
 
370 aa  259  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  34.76 
 
 
361 aa  247  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  34.47 
 
 
361 aa  244  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  38.58 
 
 
347 aa  245  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  37.23 
 
 
348 aa  243  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
347 aa  243  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  37.58 
 
 
349 aa  240  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  34.29 
 
 
361 aa  240  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  35.17 
 
 
392 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  39.3 
 
 
346 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  34.13 
 
 
392 aa  224  7e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  31.9 
 
 
367 aa  223  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  33.86 
 
 
387 aa  221  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.97 
 
 
389 aa  221  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
392 aa  220  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.11 
 
 
392 aa  220  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.54 
 
 
392 aa  220  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.83 
 
 
392 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.75 
 
 
392 aa  218  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  32.89 
 
 
387 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.71 
 
 
392 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.71 
 
 
392 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  31.62 
 
 
366 aa  215  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  36.49 
 
 
387 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.26 
 
 
392 aa  215  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  35.96 
 
 
381 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.96 
 
 
392 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.13 
 
 
392 aa  210  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  35.74 
 
 
329 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  37.68 
 
 
388 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  36.15 
 
 
389 aa  203  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  34.58 
 
 
388 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  35.16 
 
 
389 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  32.87 
 
 
381 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  34.99 
 
 
388 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  34.99 
 
 
388 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  32.85 
 
 
397 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  28.96 
 
 
450 aa  192  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  31.68 
 
 
359 aa  191  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  30.48 
 
 
357 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  30.73 
 
 
359 aa  187  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  30.85 
 
 
363 aa  187  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>