166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3201 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  100 
 
 
162 aa  330  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  75.93 
 
 
162 aa  260  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.99 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  46.15 
 
 
171 aa  133  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  41.03 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.36 
 
 
161 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  42.68 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.23 
 
 
161 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.95 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  44.59 
 
 
167 aa  124  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  43.33 
 
 
173 aa  122  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  41.61 
 
 
173 aa  121  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.97 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.97 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  37.04 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  37.5 
 
 
166 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  45.7 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  37.5 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  39.39 
 
 
165 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  36.88 
 
 
160 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  38.99 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  39.07 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  37.5 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.46 
 
 
151 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  35.53 
 
 
158 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.16 
 
 
172 aa  105  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.33 
 
 
160 aa  104  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.5 
 
 
171 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.97 
 
 
184 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  36.08 
 
 
205 aa  95.5  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.08 
 
 
184 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  40.58 
 
 
145 aa  93.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.43 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4071  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.18 
 
 
184 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.57 
 
 
220 aa  90.9  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.1 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.51 
 
 
206 aa  89  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.41 
 
 
206 aa  87.8  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.49 
 
 
206 aa  87.8  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.61 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0240  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.84 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.497247 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2630  chemotaxis protein  32.64 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.36 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.33 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.62 
 
 
171 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  35.76 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.36 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.36 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.96 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  34.51 
 
 
200 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.67 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.24 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  32.9 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.91 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  37.93 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.25 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  32.39 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.48 
 
 
204 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  32.33 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  31.47 
 
 
206 aa  79  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  32.89 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.44 
 
 
245 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.1 
 
 
253 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  29.8 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  39.02 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  31.48 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.79 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.33 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  29.11 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0731  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.61 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154797  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.11 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.53 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.72 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.37 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0186  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.78 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3692  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32 
 
 
220 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  34.51 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 
234 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.11 
 
 
253 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 
217 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.33 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3628  hypothetical protein  30.07 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0550026 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30.41 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2116  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.36 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.09 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.25 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  36.15 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>