More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3199 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  100 
 
 		 561 aa  1101    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  51.84 
 
 		 544 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  47.99 
 
 		 544 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  46.75 
 
 		 538 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 542 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 770 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  33.06 
 
 		 769 aa  353  5e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  32.74 
 
 		 769 aa  351  2e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  32.58 
 
 		 769 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 598 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  35.51 
 
 		 601 aa  333  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 607 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 728 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  34.07 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 603 aa  323  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 606 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 604 aa  319  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  32.65 
 
 		 766 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 679 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 679 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 1031 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4471  CheA signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 		 684 aa  309  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.710344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4452  CheA signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 		 680 aa  309  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4316  CheA signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 674 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 760 aa  306  9.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  40.1 
 
 		 770 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  35.78 
 
 		 742 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  37.41 
 
 		 552 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  37.41 
 
 		 552 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 671 aa  302  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 954 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 673 aa  300  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 742 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.26 
 
 		 754 aa  299  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  39.8 
 
 		 1089 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 745 aa  299  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 741 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  32.95 
 
 		 910 aa  299  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 671 aa  297  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40 
 
 		 758 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 558 aa  296  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  39.74 
 
 		 748 aa  296  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 871 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  41.03 
 
 		 785 aa  295  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 747 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 743 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 673 aa  293  4e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 747 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 739 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4461  CheA signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 662 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 681 aa  292  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  41.51 
 
 		 748 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  41.51 
 
 		 753 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.35 
 
 		 639 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  40.29 
 
 		 783 aa  290  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 674 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 919 aa  289  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  39 
 
 		 774 aa  288  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  34.26 
 
 		 744 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  38.55 
 
 		 770 aa  288  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.24 
 
 		 767 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 878 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  38.78 
 
 		 744 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 737 aa  287  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 686 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 1030 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 614 aa  286  8e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  34.25 
 
 		 723 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 655 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 957 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  39.15 
 
 		 751 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 919 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 691 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  40.56 
 
 		 734 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.59 
 
 		 927 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.44 
 
 		 734 aa  282  9e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 920 aa  281  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 652 aa  281  3e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 536 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 729 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 741 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  37.85 
 
 		 785 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0603  CheA signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 551 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 719 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 635 aa  280  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 709 aa  279  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.47 
 
 		 803 aa  279  8e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.77 
 
 		 734 aa  279  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  37.8 
 
 		 714 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0628  CheA signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 553 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 701 aa  279  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  37.41 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 695 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  39.39 
 
 		 739 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 759 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 733 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  34.76 
 
 		 754 aa  277  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  28.93 
 
 		 801 aa  277  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 679 aa  277  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>