164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3173 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3173  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  1026  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0030  hypothetical protein  64.14 
 
 
492 aa  664  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.599961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1123  putative type VI secretion protein VasR  65.58 
 
 
491 aa  672  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5594  hypothetical protein  67.71 
 
 
491 aa  694  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0716  hypothetical protein  67.55 
 
 
508 aa  714  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0091  hypothetical protein  68.4 
 
 
492 aa  704  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2026  hypothetical protein  67.55 
 
 
499 aa  714  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0279  hypothetical protein  89.07 
 
 
492 aa  922  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05862  hypothetical protein  60.12 
 
 
491 aa  644  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1673  hypothetical protein  67.55 
 
 
508 aa  714  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393568  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0869  hypothetical protein  70.61 
 
 
508 aa  717  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0046  hypothetical protein  61.33 
 
 
492 aa  637  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2124  hypothetical protein  67.55 
 
 
499 aa  714  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0314  hypothetical protein  61.8 
 
 
493 aa  649  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3614  hypothetical protein  67.3 
 
 
491 aa  692  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1197  hypothetical protein  62.87 
 
 
493 aa  655  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.73618  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3904  hypothetical protein  61.8 
 
 
493 aa  649  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2544  hypothetical protein  65.4 
 
 
491 aa  676  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00544949  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0743  hypothetical protein  67.55 
 
 
499 aa  714  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0585282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1071  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  61.68 
 
 
492 aa  647  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000440  uncharacterized protein ImpC  61.34 
 
 
491 aa  661  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3254  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  62.03 
 
 
492 aa  645  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5432  hypothetical protein  65.64 
 
 
492 aa  690  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3732  hypothetical protein  60.85 
 
 
493 aa  658  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2528  EvpB family type VI secretion protein  62.74 
 
 
491 aa  658  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43030  hypothetical protein  66.46 
 
 
491 aa  688  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0605  hypothetical protein  67.55 
 
 
508 aa  714  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0534  hypothetical protein  67.55 
 
 
760 aa  717  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.897456  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0387  EvpB family type VI secretion protein  61.8 
 
 
493 aa  649  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2806  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  61.68 
 
 
492 aa  644  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2623  hypothetical protein  60.25 
 
 
496 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2126  hypothetical protein  60.25 
 
 
496 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3225  EvpB family type VI secretion protein  60.04 
 
 
496 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1229  hypothetical protein  59.25 
 
 
490 aa  614  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.159101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0237  hypothetical protein  59.58 
 
 
491 aa  613  1e-174  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1110  type VI secretion protein, EvpB/family  59.25 
 
 
490 aa  614  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0239  hypothetical protein  59.58 
 
 
491 aa  613  1e-174  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1182  EvpB family type VI secretion protein  57.38 
 
 
482 aa  602  1e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0012  hypothetical protein  52.94 
 
 
482 aa  543  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2815  hypothetical protein  43.86 
 
 
513 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  47.79 
 
 
525 aa  453  1e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0350498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1784  hypothetical protein  46.56 
 
 
515 aa  447  1e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.170054  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0727  hypothetical protein  46.78 
 
 
516 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0778  hypothetical protein  46.78 
 
 
517 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2510  hypothetical protein  46.78 
 
 
516 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0175  hypothetical protein  46.56 
 
 
512 aa  439  1e-122  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.653266  hitchhiker  1.00045e-06 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  46.34 
 
 
535 aa  439  1e-122  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0799  EvpB family type VI secretion protein  46.56 
 
 
514 aa  441  1e-122  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.380485  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  47.58 
 
 
516 aa  439  1e-122  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5265  hypothetical protein  48.01 
 
 
515 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3124  hypothetical protein  45.23 
 
 
512 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3260  EvpB family type VI secretion protein  45.9 
 
 
512 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177977  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0160  hypothetical protein  50.57 
 
 
504 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.586065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  43.36 
 
 
499 aa  400  1e-110  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  42.77 
 
 
494 aa  400  1e-110  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.22545e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  42.89 
 
 
495 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  41.5 
 
 
498 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  42.68 
 
 
496 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  43.43 
 
 
495 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  42.41 
 
 
496 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  42.48 
 
 
496 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  42.28 
 
 
496 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  42.48 
 
 
496 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  5.70497e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  42.28 
 
 
496 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  42.28 
 
 
496 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  2.82714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  44.09 
 
 
500 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  43.2 
 
 
500 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  43.88 
 
 
500 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  43.88 
 
 
500 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  42.26 
 
 
496 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  41.67 
 
 
496 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  41.61 
 
 
496 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  42.03 
 
 
499 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  41.61 
 
 
496 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  43.04 
 
 
500 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  41.61 
 
 
496 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  42.89 
 
 
500 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  42.89 
 
 
500 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  41.34 
 
 
501 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2895  hypothetical protein  43.58 
 
 
494 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  42.89 
 
 
500 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  41.04 
 
 
496 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.26238e-06  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  41.99 
 
 
497 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  42.95 
 
 
494 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  43.58 
 
 
494 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  41.77 
 
 
500 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  42.76 
 
 
499 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  42.76 
 
 
499 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6050  hypothetical protein  39.8 
 
 
493 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  42.76 
 
 
499 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  42.76 
 
 
499 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50810  DUF877 family protein  43.79 
 
 
493 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  41.9 
 
 
497 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  43.79 
 
 
499 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0194  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  41.42 
 
 
502 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6113  EvpB family type VI secretion protein  41.88 
 
 
497 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.32673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1199  hypothetical protein  42.3 
 
 
502 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2834  hypothetical protein  42.3 
 
 
502 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  41.9 
 
 
497 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1784  hypothetical protein  42.3 
 
 
502 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>