107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3167 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  100 
 
 		 789 aa  1578    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  77.49 
 
 		 790 aa  1192    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  31.56 
 
 		 623 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  34.47 
 
 		 598 aa  163  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  28.52 
 
 		 518 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  28.17 
 
 		 518 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  28.71 
 
 		 520 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  28.99 
 
 		 520 aa  121  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  27.66 
 
 		 508 aa  119  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  25.88 
 
 		 533 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  27.1 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  26.53 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  27.57 
 
 		 533 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  41.32 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  41.32 
 
 		 627 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  41.32 
 
 		 630 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  41.32 
 
 		 638 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  25.05 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  41.32 
 
 		 635 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  41.32 
 
 		 653 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  26.56 
 
 		 524 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  22.93 
 
 		 469 aa  110  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  29.46 
 
 		 480 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  26.96 
 
 		 533 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  27.51 
 
 		 530 aa  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  26.76 
 
 		 533 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  26.67 
 
 		 523 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  26.07 
 
 		 534 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  26.28 
 
 		 475 aa  102  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  26.27 
 
 		 527 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  25.87 
 
 		 528 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  25.21 
 
 		 474 aa  94.4  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  28.91 
 
 		 498 aa  93.6  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  22.76 
 
 		 469 aa  93.2  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  25.31 
 
 		 467 aa  92  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  27.13 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  19.65 
 
 		 513 aa  82.8  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  25.6 
 
 		 487 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  23.54 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  25.6 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  23.54 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  25.64 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  30.61 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  30.08 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  25.6 
 
 		 487 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  28.57 
 
 		 470 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  33.1 
 
 		 366 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  24.14 
 
 		 434 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  29.03 
 
 		 470 aa  67  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  29.03 
 
 		 470 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  36.63 
 
 		 365 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  37.62 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  25.84 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  37.62 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  35.64 
 
 		 364 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.73 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  32.39 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.38 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  34.65 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  33.67 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  29.86 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  39.6 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  38.61 
 
 		 344 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.69 
 
 		 373 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.6 
 
 		 369 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  29.41 
 
 		 365 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  37.25 
 
 		 341 aa  52.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  33.98 
 
 		 363 aa  51.6  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  30.4 
 
 		 373 aa  51.2  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  30.16 
 
 		 373 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  30.16 
 
 		 373 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  30.16 
 
 		 373 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  30.16 
 
 		 373 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  30.16 
 
 		 373 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  30.16 
 
 		 373 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  30.16 
 
 		 373 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  34.58 
 
 		 352 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  30.77 
 
 		 373 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  30.77 
 
 		 373 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.77 
 
 		 373 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  28.68 
 
 		 369 aa  49.3  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  32.04 
 
 		 354 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.19 
 
 		 363 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  31.78 
 
 		 477 aa  49.3  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  35.48 
 
 		 368 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  29.81 
 
 		 373 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.81 
 
 		 373 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  24.29 
 
 		 435 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  24.29 
 
 		 437 aa  47.8  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  32.11 
 
 		 356 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  25.46 
 
 		 791 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  31.78 
 
 		 478 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  31.43 
 
 		 401 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  26.5 
 
 		 453 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  26.5 
 
 		 454 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  27.4 
 
 		 478 aa  46.6  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  30.89 
 
 		 347 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  33.66 
 
 		 359 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  33.66 
 
 		 359 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  33.66 
 
 		 359 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>