216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3047 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 368 aa  731    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  83.79 
 
 		 365 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  77.72 
 
 		 368 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  73.71 
 
 		 398 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  73.78 
 
 		 398 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  70.88 
 
 		 364 aa  521  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  69.32 
 
 		 363 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  62.32 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  57.7 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  54.19 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  55.07 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  54.26 
 
 		 377 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  52.57 
 
 		 380 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  56.32 
 
 		 370 aa  362  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  52.3 
 
 		 380 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  53.91 
 
 		 371 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  53.62 
 
 		 378 aa  359  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  54.65 
 
 		 374 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  54.94 
 
 		 378 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  55.37 
 
 		 386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  54.65 
 
 		 374 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  54.07 
 
 		 373 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  54.07 
 
 		 373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 		 373 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  55.23 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  51.88 
 
 		 371 aa  348  8e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  52.75 
 
 		 376 aa  345  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  50.8 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  51.98 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  51.82 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  50.95 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  48.13 
 
 		 372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  51.3 
 
 		 386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  51.54 
 
 		 375 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  51.73 
 
 		 401 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  47.44 
 
 		 371 aa  332  9e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  49.32 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  51.63 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  50.99 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  48.5 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  50.8 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  49.05 
 
 		 380 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  51.37 
 
 		 363 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  50.86 
 
 		 377 aa  325  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  51.37 
 
 		 363 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  51.23 
 
 		 367 aa  325  8.000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  48.49 
 
 		 376 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  48.52 
 
 		 369 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  52.29 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  52.12 
 
 		 378 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  49.46 
 
 		 367 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  49.17 
 
 		 390 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  50.72 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  49.02 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  51.72 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  49.15 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  49.17 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  51.72 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  49.17 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  49.17 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  49.02 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  48.63 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  49.17 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 370 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  49.17 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  48.74 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  48.74 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  48.74 
 
 		 401 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  52.29 
 
 		 374 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  48.74 
 
 		 400 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  49.32 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  49.32 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  48.74 
 
 		 394 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  48.46 
 
 		 401 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  48.99 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  48.61 
 
 		 392 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  49.58 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  47.96 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  48.56 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  49.05 
 
 		 371 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  46.9 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 362 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 365 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  49.85 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  48.41 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  49.72 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  49.03 
 
 		 377 aa  308  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  47.66 
 
 		 392 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  48.78 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0394  flagellar P-ring protein  46.49 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0514922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  47.31 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  46.94 
 
 		 382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>