289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3022 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  100 
 
 		 1124 aa  2358    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0935  4-alpha-L-fucosyltransferase  35.9 
 
 		 351 aa  238  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0640  4-alpha-L-fucosyltransferase  35.11 
 
 		 350 aa  171  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0827  4-alpha-L-fucosyltransferase  32.01 
 
 		 347 aa  163  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.447608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2125  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.63 
 
 		 355 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  35.75 
 
 		 216 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1323  hypothetical protein  28.76 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0698643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0210  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.69 
 
 		 356 aa  74.3  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.475643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  38.38 
 
 		 189 aa  72.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4194  4-alpha-L-fucosyltransferase  26.85 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0165  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.75 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  38.71 
 
 		 240 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4002  4-alpha-L-fucosyltransferase  28.35 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.783054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 239 aa  65.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3184  hypothetical protein  29.84 
 
 		 186 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  34.91 
 
 		 181 aa  65.1  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 300 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 457 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.65 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0170  4-alpha-L-fucosyltransferase  26.7 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.287995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4256  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.13 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 238 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 281 aa  59.3  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2394  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2311  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2569  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.63 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4207  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.13 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  24.14 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  42.25 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0521  4-alpha-L-fucosyltransferase  24.42 
 
 		 361 aa  57.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  38.67 
 
 		 309 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0191  4-alpha-L-fucosyltransferase  24.19 
 
 		 361 aa  57.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0131493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2572  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0366391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4138  4-alpha-L-fucosyltransferase  25.95 
 
 		 359 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.359338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4315  4-alpha-L-fucosyltransferase  25.95 
 
 		 359 aa  57.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4024  4-alpha-L-fucosyltransferase  24.19 
 
 		 361 aa  57  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3995  4-alpha-L-fucosyltransferase  26.42 
 
 		 359 aa  56.2  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0214468  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2349  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  56.2  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000150193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 317 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2379  hypothetical protein  28.27 
 
 		 186 aa  56.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.82 
 
 		 201 aa  55.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4010  4-alpha-L-fucosyltransferase  25.26 
 
 		 359 aa  55.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0156701  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4153  4-alpha-L-fucosyltransferase  25.41 
 
 		 359 aa  55.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.090997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2539  hypothetical protein  28.27 
 
 		 186 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  48.08 
 
 		 243 aa  55.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1768  hypothetical protein  28.33 
 
 		 196 aa  55.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.616513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  38 
 
 		 403 aa  54.7  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2582  hypothetical protein  28.27 
 
 		 186 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000580379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 211 aa  54.7  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4041  hypothetical protein  26.67 
 
 		 188 aa  54.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.692603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 244 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 511 aa  54.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 711 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03671  4-alpha-L-fucosyltransferase  24.74 
 
 		 359 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4183  4-alpha-L-fucosyltransferase  24.87 
 
 		 359 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  32.24 
 
 		 303 aa  53.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4157  4-alpha-L-fucosyltransferase  24.74 
 
 		 359 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.792181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 810 aa  53.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4210  4-alpha-L-fucosyltransferase  24.74 
 
 		 359 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03620  hypothetical protein  24.74 
 
 		 359 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4128  4-alpha-L-fucosyltransferase  24.74 
 
 		 359 aa  53.5  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.538398  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  24.9 
 
 		 310 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  31.29 
 
 		 308 aa  53.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5226  4-alpha-L-fucosyltransferase  25.13 
 
 		 359 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 196 aa  53.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2348  hypothetical protein  32.56 
 
 		 220 aa  52.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 330 aa  52.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 		 1162 aa  52.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 192 aa  52.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 244 aa  52.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  25.16 
 
 		 391 aa  52.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.66 
 
 		 305 aa  52.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4305  4-alpha-L-fucosyltransferase  24.74 
 
 		 359 aa  52  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0189898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 222 aa  52  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 324 aa  52  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.52 
 
 		 277 aa  51.6  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 310 aa  51.6  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 242 aa  50.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  23 
 
 		 307 aa  51.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.35 
 
 		 232 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  57.69 
 
 		 710 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.02 
 
 		 298 aa  51.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.37 
 
 		 232 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  36 
 
 		 244 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  30.26 
 
 		 303 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.28 
 
 		 317 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.02 
 
 		 298 aa  50.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 255 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 214 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.37 
 
 		 232 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 223 aa  50.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2992  methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 229 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.547914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.37 
 
 		 232 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 1312 aa  50.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 396 aa  50.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>