More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2989 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  100 
 
 		 361 aa  713    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  67.04 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  61.97 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  57.31 
 
 		 370 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  57.1 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  50.84 
 
 		 358 aa  362  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.74 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.71 
 
 		 366 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.46 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  41.32 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  42.66 
 
 		 852 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  41.41 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  41.13 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  41.13 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  42.22 
 
 		 357 aa  236  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  41.41 
 
 		 364 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  40.85 
 
 		 364 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.06 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  37.78 
 
 		 863 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  41.57 
 
 		 864 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 364 aa  222  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  34.45 
 
 		 356 aa  219  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  39.94 
 
 		 366 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  32.58 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  38.59 
 
 		 863 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  32.87 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 		 364 aa  215  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  30.4 
 
 		 358 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  30.11 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.33 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  39.34 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.28 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.85 
 
 		 351 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.43 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.93 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.24 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  36.48 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  32.24 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  36.68 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.76 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  32.87 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.57 
 
 		 364 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  36.49 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  26.55 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  38.19 
 
 		 858 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  34.99 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  34.99 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  34.99 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.84 
 
 		 372 aa  175  9e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  26.27 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  43.29 
 
 		 366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  26.27 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  36.44 
 
 		 346 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  35.82 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.15 
 
 		 498 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.65 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.35 
 
 		 496 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  29.08 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.61 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  33.61 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  25.56 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  27.91 
 
 		 359 aa  162  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  23.45 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.79 
 
 		 348 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  30.94 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.71 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.5 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.9 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.6 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  33.33 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  36.42 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  30.99 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  27.76 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  27 
 
 		 373 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  34.8 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.52 
 
 		 360 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  36.1 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  32.49 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  26.98 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.81 
 
 		 807 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.69 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.55 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.71 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.67 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  25.97 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  30.95 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.15 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 		 346 aa  139  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  34.45 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  37.07 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0235  aminotransferase class I and II  37.13 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.490059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  29.29 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  31.51 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 385 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>