More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2868 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 175 aa  349  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  96 
 
 		 175 aa  338  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  93.71 
 
 		 175 aa  332  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  90.86 
 
 		 175 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  90.86 
 
 		 175 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  87.43 
 
 		 175 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  86.21 
 
 		 175 aa  308  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  80.57 
 
 		 177 aa  286  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  67.42 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  67.98 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  66.85 
 
 		 179 aa  238  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  66.85 
 
 		 179 aa  238  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  64 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  61.71 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  62.5 
 
 		 177 aa  228  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  62.29 
 
 		 176 aa  226  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  60.8 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  60.8 
 
 		 177 aa  224  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  63.07 
 
 		 177 aa  223  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  60.23 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  59.09 
 
 		 177 aa  217  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 		 194 aa  217  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  62.07 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  60.23 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  62.07 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  60.92 
 
 		 185 aa  215  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  60.92 
 
 		 185 aa  215  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  60.92 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  60.34 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  60.34 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  60.34 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  60.34 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  60.34 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  60.34 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  60.34 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  60.34 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  57.31 
 
 		 189 aa  213  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  57.39 
 
 		 177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  60.12 
 
 		 188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 		 176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  60.12 
 
 		 202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  59.54 
 
 		 199 aa  210  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  210  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 177 aa  210  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  210  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  210  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 194 aa  210  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  210  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 194 aa  210  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  58.38 
 
 		 192 aa  209  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  58.38 
 
 		 198 aa  208  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  57.23 
 
 		 196 aa  207  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 		 176 aa  206  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  57.95 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  57.95 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  57.23 
 
 		 196 aa  206  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  52.84 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  56.5 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2336  transcription antitermination protein NusG  58.19 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000349971  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  56 
 
 		 176 aa  203  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 182 aa  203  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  53.71 
 
 		 176 aa  203  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  55.68 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  56.76 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  57.23 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  53.98 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  57.8 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  54.64 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  55.49 
 
 		 197 aa  201  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  57.23 
 
 		 203 aa  200  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  53.41 
 
 		 177 aa  200  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  54.02 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2259  NusG antitermination factor  55.49 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04536  transcription antitermination protein NusG  53.01 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  53.14 
 
 		 176 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  52.27 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  52.27 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  53.14 
 
 		 176 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  53.14 
 
 		 176 aa  198  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  53.41 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  56.65 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  52.27 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 182 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  52 
 
 		 176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>