More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2854 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
274 aa  557  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  91.24 
 
 
274 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  85.77 
 
 
274 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  85.4 
 
 
274 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  82.48 
 
 
274 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  83.21 
 
 
274 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  83.21 
 
 
274 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  75.37 
 
 
273 aa  417  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  73.53 
 
 
277 aa  418  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  72.26 
 
 
275 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  69.57 
 
 
276 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  67.88 
 
 
275 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 
276 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  66.06 
 
 
274 aa  381  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 
276 aa  380  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  66.3 
 
 
276 aa  382  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  68.61 
 
 
275 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  67.15 
 
 
275 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  68.98 
 
 
275 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 
277 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 
275 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  72.16 
 
 
276 aa  374  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  66.3 
 
 
276 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  68.36 
 
 
276 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  64 
 
 
275 aa  374  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  69.45 
 
 
276 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  65.57 
 
 
275 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 
276 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  65.22 
 
 
276 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 
274 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 
275 aa  368  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 
277 aa  367  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 
277 aa  367  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  65.07 
 
 
273 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  67.26 
 
 
282 aa  364  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  66.18 
 
 
275 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
283 aa  364  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  67.94 
 
 
274 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  66.18 
 
 
275 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
276 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 
276 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 
273 aa  364  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  65.2 
 
 
280 aa  363  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
276 aa  363  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
276 aa  363  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
276 aa  363  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
276 aa  363  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
276 aa  363  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
276 aa  363  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
276 aa  363  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  65.2 
 
 
275 aa  362  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
276 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
276 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  64.36 
 
 
274 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
276 aa  360  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
276 aa  360  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  64.1 
 
 
282 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  63.74 
 
 
282 aa  358  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  63.74 
 
 
282 aa  358  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  64.84 
 
 
282 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 
276 aa  359  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 
279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  67.15 
 
 
275 aa  355  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 
277 aa  355  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  63.37 
 
 
274 aa  350  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  65.56 
 
 
279 aa  350  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  63 
 
 
274 aa  348  8e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  63 
 
 
274 aa  346  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  61.45 
 
 
278 aa  345  5e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 
277 aa  344  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4002  ribosomal protein L2  65.33 
 
 
275 aa  343  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.712064 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 
277 aa  341  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 
277 aa  341  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 
277 aa  341  8e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 
278 aa  341  8e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 
277 aa  340  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 
274 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 
279 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  339  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  339  4e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  62.18 
 
 
276 aa  338  5e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  61.23 
 
 
277 aa  338  5e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 
276 aa  338  8e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  61.31 
 
 
276 aa  337  8e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  61.17 
 
 
276 aa  335  2.9999999999999997e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  60.95 
 
 
275 aa  334  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  64.36 
 
 
277 aa  334  9e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 
276 aa  334  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2656  ribosomal protein L2  64.47 
 
 
278 aa  333  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  63.74 
 
 
278 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  64.47 
 
 
279 aa  332  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  64.1 
 
 
278 aa  332  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  63.74 
 
 
278 aa  332  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0492  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 
277 aa  333  3e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.966251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 
277 aa  332  4e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 
277 aa  331  7.000000000000001e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 
273 aa  331  8e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0870  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 
274 aa  331  9e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3920  50S ribosomal protein L2  64.1 
 
 
279 aa  330  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  61.62 
 
 
287 aa  330  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>