More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2849 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 64 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  80.65 
 
 		 62 aa  103  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  69.35 
 
 		 62 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  69.35 
 
 		 62 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  66.13 
 
 		 62 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  61.29 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  59.68 
 
 		 62 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  62.5 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  60 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  55 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  59.65 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  51.61 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  50.82 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196069  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  54.55 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  55 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  54.55 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  54.39 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  50 
 
 		 67 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  45.9 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>